GATA2

GATA2
Ідентифікатори
Символи GATA2, DCML, IMD21, MONOMAC, NFE1B, GATA binding protein 2
Зовнішні ІД OMIM: 137295 MGI: 95662 HomoloGene: 32030 GeneCards: GATA2
Пов'язані генетичні захворювання
MonoMAC, Emberger syndrome, мієлодиспластичний синдром, гострий мієлоїдний лейкоз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
zinc ion binding
transcription factor binding
chromatin binding
C2H2 zinc finger domain binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

transcription regulator complex
нуклеоплазма
клітинне ядро
цитоплазма
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain
positive regulation of phagocytosis
диференціація клітин
negative regulation of fat cell differentiation
pituitary gland development
positive regulation of phagocytosis, engulfment
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of erythrocyte differentiation
somatic stem cell population maintenance
negative regulation of macrophage differentiation
GABAergic neuron differentiation
positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
negative regulation of fat cell proliferation
negative regulation of neural precursor cell proliferation
embryonic placenta development
neuron migration
зсідання крові
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cell maturation
semicircular canal development
transcription, DNA-templated
regulation of primitive erythrocyte differentiation
ventral spinal cord interneuron differentiation
response to lipid
cell differentiation in hindbrain
central nervous system neuron development
inner ear morphogenesis
positive regulation of neuron differentiation
regulation of histone acetylation
neuron differentiation
regulation of forebrain neuron differentiation
Фагоцитоз
urogenital system development
Детермінація
homeostasis of number of cells within a tissue
definitive hemopoiesis
neuron fate commitment
negative regulation of myeloid cell differentiation
positive regulation of megakaryocyte differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of Notch signaling pathway
eosinophil fate commitment
positive regulation of mast cell degranulation
cochlea development
regulation of hematopoietic stem cell differentiation
positive regulation of angiogenesis
negative regulation of endothelial cell apoptotic process
GO:1901313 positive regulation of gene expression
negative regulation of gene expression
кровотворення
pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
positive regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis
heart development
animal organ morphogenesis
гістогенез
розвиток клітин
anatomical structure formation involved in morphogenesis
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
digestive tract development

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2624
14461
Ensembl
ENSG00000179348
ENSMUSG00000015053
UniProt
P23769
O09100
RefSeq (мРНК)
NM_032638
NM_001145661
NM_001145662
NM_008090
NM_001355253
RefSeq (білок)
NP_001139133
NP_001139134
NP_116027
NP_032116
NP_001342182
Локус (UCSC) Хр. 3: 128.48 – 128.49 Mb Хр. 6: 88.17 – 88.18 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GATA2 (англ. GATA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 50 500[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEVAPEQPRWMAHPAVLNAQHPDSHHPGLAHNYMEPAQLLPPDEVDVFFN
HLDSQGNPYYANPAHARARVSYSPAHARLTGGQMCRPHLLHSPGLPWLDG
GKAALSAAAAHHHNPWTVSPFSKTPLHPSAAGGPGGPLSVYPGAGGGSGG
GSGSSVASLTPTAAHSGSHLFGFPPTPPKEVSPDPSTTGAASPASSSAGG
SAARGEDKDGVKYQVSLTESMKMESGSPLRPGLATMGTQPATHHPIPTYP
SYVPAAAHDYSSGLFHPGGFLGGPASSFTPKQRSKARSCSEGRECVNCGA
TATPLWRRDGTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIKPKRRLSAARRAGTCCA
NCQTTTTTLWRRNANGDPVCNACGLYYKLHNVNRPLTMKKEGIQTRNRKM
SNKSKKSKKGAECFEELSKCMQEKSSPFSAAALAGHMAPVGHLPPFSHSG
HILPTPTPIHPSSSLSFGHPHPSSMVTAMG

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lee M.-E., Temizer D.T., Clifford J.A., Quertermous T. (1991). Cloning of the GATA-binding protein that regulates endothelin-1 gene expression in endothelial cells. J. Biol. Chem. 266: 16188—16192. PMID 1714909
  • Dorfman D.M., Wilson D.B., Bruns G.A.P., Orkin S.H. (1992). Human transcription factor GATA-2. Evidence for regulation of preproendothelin-1 gene expression in endothelial cells. J. Biol. Chem. 267: 1279—1285. PMID 1370462

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з GATA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4171 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, P23769 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші