HIVEP2

HIVEP2
Ідентифікатори
Символи HIVEP2, HIV-EP2, MBP-2, MIBP1, SHN2, ZAS2, ZNF40B, human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2, MRD43
Зовнішні ІД OMIM: 143054 MGI: 1338076 HomoloGene: 4900 GeneCards: HIVEP2
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 43[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма

Біологічний процес

multicellular organism development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
GO:0072468 сигнальна трансдукція
transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3097
15273
Ensembl
ENSG00000010818
ENSMUSG00000015501
UniProt
P31629
Q3UHF7
RefSeq (мРНК)
NM_006734
NM_010437
NM_001358782
NM_001358783
RefSeq (білок)
NP_006725
NP_034567
NP_001345711
NP_001345712
Локус (UCSC) Хр. 6: 142.75 – 142.96 Mb Хр. 10: 13.97 – 14.15 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HIVEP2 (англ. Human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 446 амінокислот, а молекулярна маса — 269 053[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDTGDTALGQKATSRSGETDKASGRWRQEQSAVIKMSTFGSHEGQRQPQI
EPEQIGNTASAQLFGSGKLASPSEVVQQVAEKQYPPHRPSPYSCQHSLSF
PQHSLPQGVMHSTKPHQSLEGPPWLFPGPLPSVASEDLFPFPIHGHSGGY
PRKKISSLNPAYSQYSQKSIEQAEEAHKKEHKPKKPGKYICPYCSRACAK
PSVLKKHIRSHTGERPYPCIPCGFSFKTKSNLYKHRKSHAHAIKAGLVPF
TESAVSKLDLEAGFIDVEAEIHSDGEQSTDTDEESSLFAEASDKMSPGPP
IPLDIASRGGYHGSLEESLGGPMKVPILIIPKSGIPLPNESSQYIGPDML
PNPSLNTKADDSHTVKQKLALRLSEKKGQDSEPSLNLLSPHSKGSTDSGY
FSRSESAEQQISPPNTNAKSYEEIIFGKYCRLSPRNALSVTTTSQERAAM
GRKGIMEPLPHVNTRLDVKMFEDPVSQLIPSKGDVDPSQTSMLKSTKFNS
ESRQPQIIPSSIRNEGKLYPANFQGSNPVLLEAPVDSSPLIRSNSVPTSS
ATNLTIPPSLRGSHSFDERMTGSDDVFYPGTVGIPPQRMLRRQAAFELPS
VQEGHVEVEHHGRMLKGISSSSLKEKKLSPGDRVGYDYDVCRKPYKKWED
SETPKQNYRDISCLSSLKHGGEYFMDPVVPLQGVPSMFGTTCENRKRRKE
KSVGDEEDTPMICSSIVSTPVGIMASDYDPKLQMQEGVRSGFAMAGHENL
SHGHTERFDPCRPQLQPGSPSLVSEESPSAIDSDKMSDLGGRKPPGNVIS
VIQHTNSLSRPNSFERSESAELVACTQDKAPSPSETCDSEISEAPVSPEW
APPGDGAESGGKPSPSQQVQQQSYHTQPRLVRQHNIQVPEIRVTEEPDKP
EKEKEAQSKEPEKPVEEFQWPQRSETLSQLPAEKLPPKKKRLRLADMEHS
SGESSFESTGTGLSRSPSQESNLSHSSSFSMSFEREETSKLSALPKQDEF
GKHSEFLTVPAGSYSLSVPGHHHQKEMRRCSSEQMPCPHPAEVPEVRSKS
FDYGNLSHAPVSGAAASTVSPSRERKKCFLVRQASFSGSPEISQGEVGMD
QSVKQEQLEHLHAGLRSGWHHGPPAVLPPLQQEDPGKQVAGPCPPLSSGP
LHLAQPQIMHMDSQESLRNPLIQPTSYMTSKHLPEQPHLFPHQETIPFSP
IQNALFQFQYPTVCMVHLPAQQPPWWQAHFPHPFAQHPQKSYGKPSFQTE
IHSSYPLEHVAEHTGKKPAEYAHTKEQTYPCYSGASGLHPKNLLPKFPSD
QSSKSTETPSEQVLQEDFASANAGSLQSLPGTVVPVRIQTHVPSYGSVMY
TSISQILGQNSPAIVICKVDENMTQRTLVTNAAMQGIGFNIAQVLGQHAG
LEKYPIWKAPQTLPLGLESSIPLCLPSTSDSVATLGGSKRMLSPASSLEL
FMETKQQKRVKEEKMYGQIVEELSAVELTNSDIKKDLSRPQKPQLVRQGC
ASEPKDGLQSGSSSFSSLSPSSSQDYPSVSPSSREPFLPSKEMLSGSRAP
LPGQKSSGPSESKESSDELDIDETASDMSMSPQSSSLPAGDGQLEEEGKG
HKRPVGMLVRMASAPSGNVADSTLLLTDMADFQQILQFPSLRTTTTVSWC
FLNYTKPNYVQQATFKSSVYASWCISSCNPNPSGLNTKTTLALLRSKQKI
TAEIYTLAAMHRPGTGKLTSSSAWKQFTQMKPDASFLFGSKLERKLVGNI
LKERGKGDIHGDKDIGSKQTEPIRIKIFEGGYKSNEDYVYVRGRGRGKYI
CEECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPYVCKLCNFAFKTKGNLTKHMKSKA
HMKKCLELGVSMTSVDDTETEEAENLEDLHKAAEKHSMSSISTDHQFSDA
EESDGEDGDDNDDDDEDEDDFDDQGDLTPKTRSRSTSPQPPRFSSLPVNV
GAVPHGVPSDSSLGHSSLISYLVTLPSIRVTQLMTPSDSCEDTQMTEYQR
LFQSKSTDSEPDKDRLDIPSCMDEECMLPSEPSSSPRDFSPSSHHSSPGY
DSSPCRDNSPKRYLIPKGDLSPRRHLSPRRDLSPMRHLSPRKEAALRREM
SQRDVSPRRHLSPRRPVSPGKDITARRDLSPRRERRYMTTIRAPSPRRAL
YHNPPLSMGQYLQAEPIVLGPPNLRRGLPQVPYFSLYGDQEGAYEHPGSS
LFPEGPNDYVFSHLPLHSQQQVRAPIPMVPVGGIQMVHSMPPALSSLHPS
PTLPLPMEGFEEKKGASGESFSKDPYVLSKQHEKRGPHALQSSGPPSTPS
SPRLLMKQSTSEDSLNATEREQEENIQTCTKAIASLRIATEEAALLGPDQ
PARVQEPHQNPLGSAHVSIRHFSRPEPGQPCTSATHPDLHDGEKDNFGTS
QTPLAHSTFYSKSCVDDKQLDFHSSKELSSSTEESKDPSSEKSQLH

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Van't Veer L.J., Lutz P., Isselbacher K.J., Bernards R. (1992). Structure and expression of MBP-2: a 275 kDa zinc finger protein that binds to an enhancer of major histocompatibility complex class 1 genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 8971—8975. PMID 1409593 DOI:10.1073/pnas.89.19.8971
  • Rustgi A.K., Van't Veer L.J., Bernards R. (1990). Two genes encode factors with NF-kappa B- and H2TF1-like DNA-binding properties. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 8707—8710. PMID 2247438 DOI:10.1073/pnas.87.22.8707

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з HIVEP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4921 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  5. UniProt, P31629 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші