NFKB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1MDI, 1MDJ, 1MDK, 1NFI, 1SVC, 2DBF, 2O61, 3GUT

Ідентифікатори

Символи

NFKB1, EBP-1, KBF1, NF-kB1, NF-kappa-B, NF-kappaB, NFKB-p105, NFKB-p50, NFkappaB, p105, p50, CVID12, nuclear factor kappa B subunit 1, NF-kappa-B1, NF-kB, NF-kappabeta

Зовнішні ІД

OMIM: 164011 MGI: 97312 HomoloGene: 2971 GeneCards: NFKB1

Пов'язані генетичні захворювання

шизофренія, immunodeficiency, common variable, 12^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • actinin binding • identical protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • мітохондрія • клітинне ядро • I-kappaB/NF-kappaB complex • нуклеоплазма • extracellular region • гіалоплазма • secretory granule lumen • specific granule lumen
Біологічний процес	• cellular response to interleukin-6 • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of vitamin D biosynthetic process • Fc-epsilon receptor signaling pathway • cellular response to mechanical stimulus • NIK/NF-kappaB signaling • stress-activated MAPK cascade • negative regulation of inflammatory response • GO:0097285 апоптоз • response to muscle stretch • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity • positive regulation of hyaluronan biosynthetic process • membrane protein intracellular domain proteolysis • inflammatory response • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of miRNA metabolic process • cellular response to nicotine • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of cholesterol transport • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0032697 negative regulation of cytokine production • positive regulation of lipid storage • cellular response to dsRNA • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interleukin-1 • вроджений імунітет • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of gene expression • neutrophil degranulation • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to angiotensin • interleukin-1-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4790


18033

Ensembl


ENSG00000109320


ENSMUSG00000028163

UniProt


P19838


P25799

RefSeq (мРНК)

NM_001165412 NM_003998 NM_001319226 NM_001382625 NM_001382626
NM_001382627 NM_001382628


NM_008689

RefSeq (білок)

NP_001158884 NP_001306155 NP_003989 NP_001369554 NP_001369555
NP_001369556 NP_001369557 NP_001158884.1 NP_001306155.1


NP_032715

Локус (UCSC)

Хр. 4: 102.5 – 102.62 Mb

Хр. 3: 135.29 – 135.4 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NFKB1 (англ. Nuclear factor kappa B subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 105 356^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDDPYLGR	PEQMFHLDPS	LTHTIFNPEV	FQPQMALPTD	GPYLQILEQP
KQRGFRFRYV	CEGPSHGGLP	GASSEKNKKS	YPQVKICNYV	GPAKVIVQLV
TNGKNIHLHA	HSLVGKHCED	GICTVTAGPK	DMVVGFANLG	ILHVTKKKVF
ETLEARMTEA	CIRGYNPGLL	VHPDLAYLQA	EGGGDRQLGD	REKELIRQAA
LQQTKEMDLS	VVRLMFTAFL	PDSTGSFTRR	LEPVVSDAIY	DSKAPNASNL
KIVRMDRTAG	CVTGGEEIYL	LCDKVQKDDI	QIRFYEEEEN	GGVWEGFGDF
SPTDVHRQFA	IVFKTPKYKD	INITKPASVF	VQLRRKSDLE	TSEPKPFLYY
PEIKDKEEVQ	RKRQKLMPNF	SDSFGGGSGA	GAGGGGMFGS	GGGGGGTGST
GPGYSFPHYG	FPTYGGITFH	PGTTKSNAGM	KHGTMDTESK	KDPEGCDKSD
DKNTVNLFGK	VIETTEQDQE	PSEATVGNGE	VTLTYATGTK	EESAGVQDNL
FLEKAMQLAK	RHANALFDYA	VTGDVKMLLA	VQRHLTAVQD	ENGDSVLHLA
IIHLHSQLVR	DLLEVTSGLI	SDDIINMRND	LYQTPLHLAV	ITKQEDVVED
LLRAGADLSL	LDRLGNSVLH	LAAKEGHDKV	LSILLKHKKA	ALLLDHPNGD
GLNAIHLAMM	SNSLPCLLLL	VAAGADVNAQ	EQKSGRTALH	LAVEHDNISL
AGCLLLEGDA	HVDSTTYDGT	TPLHIAAGRG	STRLAALLKA	AGADPLVENF
EPLYDLDDSW	ENAGEDEGVV	PGTTPLDMAT	SWQVFDILNG	KPYEPEFTSD
DLLAQGDMKQ	LAEDVKLQLY	KLLEIPDPDK	NWATLAQKLG	LGILNNAFRL
SPAPSKTLMD	NYEVSGGTVR	ELVEALRQMG	YTEAIEVIQA	ASSPVKTTSQ
AHSLPLSPAS	TRQQIDELRD	SDSVCDSGVE	TSFRKLSFTE	SLTSGASLLT
LNKMPHDYGQ	EGPLEGKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Bours V., Villalobos J., Burd P.R., Kelly K., Siebenlist U. (1990). Cloning of a mitogen-inducible gene encoding a kappa B DNA-binding protein with homology to the rel oncogene and to cell-cycle motifs. Nature. 348: 76—80. PMID 2234062 DOI:10.1038/348076a0
Heron E., Deloukas P., van Loon A.P.G.M. (1995). The complete exon-intron structure of the 156-kb human gene NFKB1, which encodes the p105 and p50 proteins of transcription factors NF-kappa B and I kappa B-gamma: implications for NF-kappa B-mediated signal transduction. Genomics. 30: 493—505. PMID 8825636 DOI:10.1006/geno.1995.1270
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Palombella V.J., Rando O.J., Goldberg A.L., Maniatis T. (1994). The ubiquitin-proteasome pathway is required for processing the NF-kappa B1 precursor protein and the activation of NF-kappa B. Cell. 78: 773—785. PMID 8087845 DOI:10.1016/S0092-8674(94)90482-0
Lin L., Ghosh S. (1996). A glycine-rich region in NF-kappaB p105 functions as a processing signal for the generation of the p50 subunit. Mol. Cell. Biol. 16: 2248—2254. PMID 8628291 DOI:10.1128/MCB.16.5.2248
Matthews J.R., Botting C.H., Panico M., Morris H.R., Hay R.T. (1996). Inhibition of NF-kappaB DNA binding by nitric oxide. Nucleic Acids Res. 24: 2236—2242. PMID 8710491 DOI:10.1093/nar/24.12.2236

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NFKB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7794 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P19838 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма