NEUROD2

NEUROD2
Ідентифікатори
Символи NEUROD2, NDRF, bHLHa1, neuronal differentiation 2, EIEE72, DEE72
Зовнішні ІД OMIM: 601725 MGI: 107755 HomoloGene: 4489 GeneCards: NEUROD2
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001106 transcription corepressor activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
E-box binding
protein heterodimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

cellular response to calcium ion
regulation of neuron differentiation
диференціація клітин
negative regulation of nucleic acid-templated transcription
positive regulation of calcium-mediated signaling
associative learning
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
neuron development
transcription by RNA polymerase II
behavioral fear response
transcription, DNA-templated
нейробіологія розвитку
positive regulation of synaptic plasticity
negative regulation of synapse maturation
multicellular organism development
positive regulation of synapse maturation
Убіквітин-залежний протеоліз
positive regulation of neuron differentiation
cerebellar cortex development
regulation of synapse maturation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to electrical stimulus

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4761
18013
Ensembl
ENSG00000171532
ENSMUSG00000038255
UniProt
Q15784
Q62414
RefSeq (мРНК)
NM_006160
NM_010895
RefSeq (білок)
NP_006151
NP_035025
Локус (UCSC) Хр. 17: 39.6 – 39.61 Mb Хр. 11: 98.22 – 98.22 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NEUROD2 (англ. Neuronal differentiation 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот, а молекулярна маса — 41 361[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLTRLFSEPGLLSDVPKFASWGDGEDDEPRSDKGDAPPPPPPAPGPGAPG
PARAAKPVPLRGEEGTEATLAEVKEEGELGGEEEEEEEEEEGLDEAEGER
PKKRGPKKRKMTKARLERSKLRRQKANARERNRMHDLNAALDNLRKVVPC
YSKTQKLSKIETLRLAKNYIWALSEILRSGKRPDLVSYVQTLCKGLSQPT
TNLVAGCLQLNSRNFLTEQGADGAGRFHGSGGPFAMHPYPYPCSRLAGAQ
CQAAGGLGGGAAHALRTHGYCAAYETLYAAAGGGGASPDYNSSEYEGPLS
PPLCLNGNFSLKQDSSPDHEKSYHYSMHYSALPGSRPTGHGLVFGSSAVR
GGVHSENLLSYDMHLHHDRGPMYEELNAFFHN

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kitamura T., Miyachi T., Nakamura S., Kawakami H. (1999). Identification and analysis of the promoter region of the human NeuroD-related factor (NDRF). Biochim. Biophys. Acta. 1445: 142—147. PMID 10209266 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00038-X
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7763 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q15784 (англ.) . Архів оригіналу за 11 жовтня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.