DIDO1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2M3H, 4L7X

Ідентифікатори

Символи

DIDO1, BYE1, C20orf158, DATF-1, DATF1, DIDO2, DIDO3, DIO-1, DIO1, dJ885L7.8, death inducer-obliterator 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604140 MGI: 1344352 HomoloGene: 34139 GeneCards: DIDO1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • веретено поділу • цитоскелет • клітинне ядро
Біологічний процес	• apoptotic signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11083


23856

Ensembl


ENSG00000101191


ENSMUSG00000038914

UniProt


Q9BTC0


Q8C9B9

RefSeq (мРНК)

NM_001193369 NM_001193370 NM_022105 NM_033081 NM_080796
NM_080797 NM_152302


NM_001291432 NM_001291433 NM_011805 NM_175551 NM_177852

RefSeq (білок)

NP_001180298 NP_001180299 NP_071388 NP_149072 NP_542986
NP_542987


NP_001278361 NP_001278362 NP_035935 NP_780760 NP_808520

Локус (UCSC)

Хр. 20: 62.88 – 62.94 Mb

Хр. 2: 180.3 – 180.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DIDO1 (англ. Death inducer-obliterator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 240 амінокислот, а молекулярна маса — 243 873^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDKGDPSNE	EAPKAIKPTS	KEFRKTWGFR	RTTIAKREGA	GDAEADPLEP
PPPQQQLGLS	LRRSGRQPKR	TERVEQFLTI	ARRRGRRSMP	VSLEDSGEPT
SCPATDAETA	SEGSVESASE	TRSGPQSAST	AVKERPASSE	KVKGGDDHDD
TSDSDSDGLT	LKELQNRLRR	KREQEPTERP	LKGIQSRLRK	KRREEGPAET
VGSEASDTVE	GVLPSKQEPE	NDQGVVSQAG	KDDRESKLEG	KAAQDIKDEE
PGDLGRPKPE	CEGYDPNALY	CICRQPHNNR	FMICCDRCEE	WFHGDCVGIS
EARGRLLERN	GEDYICPNCT	ILQVQDETHS	ETADQQEAKW	RPGDADGTDC
TSIGTIEQKS	SEDQGIKGRI	EKAANPSGKK	KLKIFQPVIE	APGASKCIGP
GCCHVAQPDS	VYCSNDCILK	HAAATMKFLS	SGKEQKPKPK	EKMKMKPEKP
SLPKCGAQAG	IKISSVHKRP	APEKKETTVK	KAVVVPARSE	ALGKEAACES
STPSWASDHN	YNAVKPEKTA	APSPSLLYKS	TKEDRRSEEK	AAAMAASKKT
APPGSAVGKQ	PAPRNLVPKK	SSFANVAAAT	PAIKKPPSGF	KGTIPKRPWL
SATPSSGASA	ARQAGPAPAA	ATAASKKFPG	SAALVGAVRK	PVVPSVPMAS
PAPGRLGAMS	AAPSQPNSQI	RQNIRRSLKE	ILWKRVNDSD	DLIMTENEVG
KIALHIEKEM	FNLFQVTDNR	YKSKYRSIMF	NLKDPKNQGL	FHRVLREEIS
LAKLVRLKPE	ELVSKELSTW	KERPARSVME	SRTKLHNESK	KTAPRQEAIP
DLEDSPPVSD	SEEQQESARA	VPEKSTAPLL	DVFSSMLKDT	TSQHRAHLFD
LNCKICTGQV	PSAEDEPAPK	KQKLSASVKK	EDLKSKHDSS	APDPAPDSAD
EVMPEAVPEV	ASEPGLESAS	HPNVDRTYFP	GPPGDGHPEP	SPLEDLSPCP
ASCGSGVVTT	VTVSGRDPRT	APSSSCTAVA	SAASRPDSTH	MVEARQDVPK
PVLTSVMVPK	SILAKPSSSP	DPRYLSVPPS	PNISTSESRS	PPEGDTTLFL
SRLSTIWKGF	INMQSVAKFV	TKAYPVSGCF	DYLSEDLPDT	IHIGGRIAPK
TVWDYVGKLK	SSVSKELCLI	RFHPATEEEE	VAYISLYSYF	SSRGRFGVVA
NNNRHVKDLY	LIPLSAQDPV	PSKLLPFEGP	GLESPRPNII	LGLVICQKIK
RPANSGELDK	MDEKRTRLQP	EEADVPAYPK	VATVPQSEKK	PSKYPLCSAD
AAVSTTPPGS	PPPPPPLPEP	PVLKVLSSLK	PAAPSPATAA	TTAAAASTAA
SSTASSASKT	ASPLEHILQT	LFGKKKSFDP	SAREPPGSTA	GLPQEPKTTA
EDGVPAPPLL	DPIVQQFGQF	SKDKALEEEE	DDRPYDPEEE	YDPERAFDTQ
LVERGRRHEV	ERAPEAAAAE	REEVAYDPED	ETILEEAKVT	VDDLPNRMCA
DVRRNSVERP	AEPVAGAATP	SLVEQQKMLE	ELNKQIEEQK	RQLEEQEEAL
RQQRAAVGVS	MAHFSVSDAL	MSPPPKSSLP	KAELFQQEQQ	SADKPASLPP
ASQASNHRDP	RQARRLATET	GEGEGEPLSR	LSARGAQGAL	PERDASRGGL
VGQAPMPVPE	EKEPASSPWA	SGEKPPAGSE	QDGWKAEPGE	GTRPATVGDS
SARPARRVLL	PTPPCGALQP	GFPLQHDGER	DPFTCPGFAS	QDKALGSAQY
EDPRNLHSAG	RSSSPAGETE	GDREPQARPG	EGTAPLPPPG	QKVGGSQPPF
QGQREPGPHA	LGMSGLHGPN	FPGPRGPAPP	FPEENIASND	GPRGPPPARF
GAQKGPIPSL	FSGQHGPPPY	GDSRGPSPSY	LGGPRGVAPS	QFEERKDPHG
EKREFQDAPY	NEVTGAPAQF	EGTEQAPFLG	SRGGAPFQFG	GQRRPLLSQL
KGPRGGPPPS	QFGGQRGPPP	GHFVGPRGPH	PSQFETARGP	HPNQFEGPRG
QAPNFMPGPR	GIQPQQFEDQ	RVHSPPRFTN	QRAPAPLQFG	GLRGSAPFSE
KNEQTPSRFH	FQGQAPQVMK	PGPRPLLELP	SHPPQHRKDR	WEEAGPPSAL
SSSAPGQGPE	ADGQWASADF	REGKGHEYRN	QTFEGRQRER	FDVGPKEKPL
EEPDAQGRAS	EDRRRERERG	RNWSRERDWD	RPREWDRHRD	KDSSRDWDRN
RERSANRDRE	READRGKEWD	RSRERSRNRE	RERDRRRDRD	RSRSRERDRD
KARDRERGRD	RKDRSKSKES	ARDPKPEASR	ASDAGTASQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2680 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BTC0 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма