CBFA2T3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | CBFA2T3, ETO2, MTG16, MTGR2, ZMYND4, RUNX1T3, CBFA2/RUNX1 translocation partner 3, CBFA2/RUNX1 partner transcriptional co-repressor 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603870 MGI: 1338013 HomoloGene: 74543 GeneCards: CBFA2T3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001106 transcription corepressor activity |
---|
Клітинна компонента | • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • ядерце • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of aerobic respiration • диференціація клітин • проліферація • negative regulation of glycolytic process • response to hypoxia • granulocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001109873 NM_009824 NM_177289 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001103343 NP_033954 NP_796263 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 88.87 – 88.98 Mb | Хр. 8: 123.35 – 123.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CBFA2T3 (англ. CBFA2/RUNX1 translocation partner 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 653 амінокислот, а молекулярна маса — 71 192[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPASRLRDRA | | ASSASGSTCG | | SMSQTHPVLE | | SGLLASAGCS | | APRGPRKGGP |
APVDRKAKAS | | AMPDSPAEVK | | TQPRSTPPSM | | PPPPPAASQG | | ATRPPSFTPH |
THREDGPATL | | PHGRFHGCLK | | WSMVCLLMNG | | SSHSPTAING | | APCTPNGFSN |
GPATSSTASL | | STQHLPPACG | | ARQLSKLKRF | | LTTLQQFGSD | | ISPEIGERVR |
TLVLGLVNST | | LTIEEFHSKL | | QEATNFPLRP | | FVIPFLKANL | | PLLQRELLHC |
ARLAKQTPAQ | | YLAQHEQLLL | | DASASSPIDS | | SELLLEVNEN | | GKRRTPDRTK |
ENGSDRDPLH | | PEHLSKRPCT | | LNPAQRYSPS | | NGPPQPTPPP | | HYRLEDIAMA |
HHFRDAYRHP | | DPRELRERHR | | PLVVPGSRQE | | EVIDHKLTER | | EWAEEWKHLN |
NLLNCIMDMV | | EKTRRSLTVL | | RRCQEADREE | | LNHWARRYSD | | AEDTKKGPAP |
AAARPRSSSA | | GPEGPQLDVP | | REFLPRTLTG | | YVPEDIWRKA | | EEAVNEVKRQ |
AMSELQKAVS | | DAERKAHELI | | TTERAKMERA | | LAEAKRQASE | | DALTVINQQE |
DSSESCWNCG | | RKASETCSGC | | NAARYCGSFC | | QHRDWEKHHH | | VCGQSLQGPT |
AVVADPVPGP | | PEAAHSLGPS | | LPVGAASPSE | | AGSAGPSRPG | | SPSPPGPLDT |
VPR |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, мембрані, апараті гольджі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Calabi F., Cilli V. (1998). CBFA2T1, a gene rearranged in human leukemia, is a member of a multigene family. Genomics. 52: 332—341. PMID 9790752 DOI:10.1006/geno.1998.5429
- Schillace R.V., Andrews S.F., Liberty G.A., Davey M.P., Carr D.W. (2002). Identification and characterization of myeloid translocation gene 16b as a novel a kinase anchoring protein in T lymphocytes. J. Immunol. 168: 1590—1599. PMID 11823486 DOI:10.4049/jimmunol.168.4.1590
- Davis J.N., McGhee L., Meyers S. (2003). The ETO (MTG8) gene family. Gene. 303: 1—10. PMID 12559562 DOI:10.1016/S0378-1119(02)01172-1
- Rossetti S., Hoogeveen A.T., Sacchi N. (2004). The MTG proteins: chromatin repression players with a passion for networking. Genomics. 84: 1—9. PMID 15203199 DOI:10.1016/j.ygeno.2004.02.011
- Lindberg S.R., Olsson A., Persson A.-M., Olsson I. (2005). The leukemia-associated ETO homologues are differently expressed during hematopoietic differentiation. Exp. Hematol. 33: 189—198. PMID 15676213 DOI:10.1016/j.exphem.2004.10.011
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1537 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O75081 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|