KLF15

KLF15
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2ENT

Ідентифікатори
Символи KLF15, KKLF, Kruppel-like factor 15, Kruppel like factor 15
Зовнішні ІД OMIM: 606465 MGI: 1929988 HomoloGene: 8553 GeneCards: KLF15
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

регуляція експресії генів
glomerular visceral epithelial cell differentiation
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of peptidyl-lysine acetylation
glial cell differentiation
cardiac muscle hypertrophy in response to stress
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of glucose import
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular glucose homeostasis
response to insulin
cellular response to peptide

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
28999
66277
Ensembl
ENSG00000163884
ENSMUSG00000030087
UniProt
Q9UIH9
Q9EPW2
RefSeq (мРНК)
NM_014079
NM_023184
NM_001355668
RefSeq (білок)
NP_054798
NP_075673
NP_001342597
Локус (UCSC) Хр. 3: 126.34 – 126.36 Mb Хр. 6: 90.44 – 90.45 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KLF15 (англ. Kruppel like factor 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 43 992[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVDHLLPVDENFSSPKCPVGYLGDRLVGRRAYHMLPSPVSEDDSDASSPC
SCSSPDSQALCSCYGGGLGTESQDSILDFLLSQATLGSGGGSGSSIGASS
GPVAWGPWRRAAAPVKGEHFCLPEFPLGDPDDVPRPFQPTLEEIEEFLEE
NMEPGVKEVPEGNSKDLDACSQLSAGPHKSHLHPGSSGRERCSPPPGGAS
AGGAQGPGGGPTPDGPIPVLLQIQPVPVKQESGTGPASPGQAPENVKVAQ
LLVNIQGQTFALVPQVVPSSNLNLPSKFVRIAPVPIAAKPVGSGPLGPGP
AGLLMGQKFPKNPAAELIKMHKCTFPGCSKMYTKSSHLKAHLRRHTGEKP
FACTWPGCGWRFSRSDELSRHRRSHSGVKPYQCPVCEKKFARSDHLSKHI
KVHRFPRSSRSVRSVN

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14536 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q9UIH9 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші