FOXH1

FOXH1
Ідентифікатори
Символи FOXH1, FAST-1, FAST1, forkhead box H1
Зовнішні ІД OMIM: 603621 MGI: 1347465 HomoloGene: 2914 GeneCards: FOXH1
Онтологія гена
Молекулярна функція

co-SMAD binding
GO:0001104 transcription coregulator activity
protein domain specific binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
androgen receptor binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
bHLH transcription factor binding
DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
R-SMAD binding
SMAD binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
activin responsive factor complex
transcription regulator complex
клітинне ядро

Біологічний процес

ventricular trabecula myocardium morphogenesis
anterior/posterior pattern specification
negative regulation of androgen receptor signaling pathway
embryonic heart tube anterior/posterior pattern specification
transcription, DNA-templated
outflow tract morphogenesis
nodal signaling pathway involved in determination of lateral mesoderm left/right asymmetry
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
heart looping
axial mesoderm development
cardiac right ventricle morphogenesis
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
determination of left/right symmetry
secondary heart field specification
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
aorta morphogenesis
transcription by RNA polymerase II
negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to cytokine stimulus
anatomical structure morphogenesis
диференціація клітин
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8928
14106
Ensembl
ENSG00000160973
ENSMUSG00000033837
UniProt
O75593
O88621
RefSeq (мРНК)
NM_003923
NM_007989
RefSeq (білок)
NP_003914
NP_032015
Локус (UCSC) Хр. 8: 144.47 – 144.48 Mb Хр. 15: 76.55 – 76.55 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXH1 (англ. Forkhead box H1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 39 257[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGPCSGSRLGPPEAESPSQPPKRRKKRYLRHDKPPYTYLAMIALVIQAAP
SRRLKLAQIIRQVQAVFPFFREDYEGWKDSIRHNLSSNRCFRKVPKDPAK
PQAKGNFWAVDVSLIPAEALRLQNTALCRRWQNGGARGAFAKDLGPYVLH
GRPYRPPSPPPPPSEGFSIKSLLGGSGEGAPWPGLAPQSSPVPAGTGNSG
EEAVPTPPLPSSERPLWPLCPLPGPTRVEGETVQGGAIGPSTLSPEPRAW
PLHLLQGTAVPGGRSSGGHRASLWGQLPTSYLPIYTPNVVMPLAPPPTSC
PQCPSTSPAYWGVAPETRGPPGLLCDLDALFQGVPPNKSIYDVWVSHPRD
LAAPGPGWLLSWCSL

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Zhou S., Zawel L., Lengauer C., Kinzler K.W., Vogelstein B. (1998). Characterization of human FAST-1, a TGF beta and activin signal transducer. Mol. Cell. 2: 121—127. PMID 9702198 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80120-3

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3814 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, O75593 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші