ATF4

ATF4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1CI6

Ідентифікатори
Символи ATF4, CREB-2, CREB2, TAXREB67, TXREB, activating transcription factor 4
Зовнішні ІД OMIM: 604064 MGI: 88096 HomoloGene: 1266 GeneCards: ATF4
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
core promoter sequence-specific DNA binding
protein C-terminus binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
leucine zipper domain binding
protein heterodimerization activity
protein kinase binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
ATF1-ATF4 transcription factor complex
ATF4-CREB1 transcription factor complex
transcription regulator complex
dendrite membrane
клітинне ядро
Lewy body core
nuclear periphery
мембрана
клітинна мембрана
нуклеоплазма
центр організації мікротрубочок
neuron projection
цитоскелет
CHOP-ATF4 complex
центросома
GO:0009327 protein-containing complex
RNA polymerase II transcription regulator complex

Біологічний процес

gamma-aminobutyric acid signaling pathway
глюконеогенез
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of oxidative stress-induced neuron death
cellular response to amino acid starvation
mRNA transcription by RNA polymerase II
circadian regulation of gene expression
response to endoplasmic reticulum stress
PERK-mediated unfolded protein response
response to manganese-induced endoplasmic reticulum stress
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of neuron apoptotic process
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress
циркадний ритм
negative regulation of potassium ion transport
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance
cellular response to glucose starvation
negative regulation of translational initiation in response to stress
ритмічний процес
cellular response to UV
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress
cellular amino acid metabolic process
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
positive regulation of apoptotic process
positive regulation of vascular endothelial growth factor production
positive regulation of transcription by RNA polymerase I
cellular response to dopamine
response to toxic substance
neuron differentiation
cellular response to oxygen-glucose deprivation
positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway
cellular calcium ion homeostasis
positive regulation of biomineral tissue development
negative regulation of cold-induced thermogenesis
positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process
positive regulation of sodium-dependent phosphate transport

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
468
11911
Ensembl
ENSG00000128272
ENSMUSG00000042406
UniProt
P18848
Q06507
RefSeq (мРНК)
NM_182810
NM_001675
NM_001287180
NM_009716
RefSeq (білок)
NP_001666
NP_877962
NP_001274109
NP_033846
Локус (UCSC) Хр. 22: 39.52 – 39.52 Mb Хр. 15: 80.14 – 80.14 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ATF4 (англ. Activating transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 590[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTEMSFLSSEVLVGDLMSPFDQSGLGAEESLGLLDDYLEVAKHFKPHGFS
SDKAKAGSSEWLAVDGLVSPSNNSKEDAFSGTDWMLEKMDLKEFDLDALL
GIDDLETMPDDLLTTLDDTCDLFAPLVQETNKQPPQTVNPIGHLPESLTK
PDQVAPFTFLQPLPLSPGVLSSTPDHSFSLELGSEVDITEGDRKPDYTAY
VAMIPQCIKEEDTPSDNDSGICMSPESYLGSPQHSPSTRGSPNRSLPSPG
VLCGSARPKPYDPPGEKMVAAKVKGEKLDKKLKKMEQNKTAATRYRQKKR
AEQEALTGECKELEKKNEALKERADSLAKEIQYLKDLIEEVRKARGKKRV
P

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані.

Література

  • Karpinski B.A., Morle G.D., Huggenvik J., Uhler M.D., Leiden J.M. (1992). Molecular cloning of human CREB-2: an ATF/CREB transcription factor that can negatively regulate transcription from the cAMP response element. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 4820—4824. PMID 1534408 DOI:10.1073/pnas.89.11.4820
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
  • Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K., Hayashi H. (2005). TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death. EMBO J. 24: 1243—1255. PMID 15775988 DOI:10.1038/sj.emboj.7600596
  • Su N., Kilberg M.S. (2008). C/EBP homology protein (CHOP) interacts with activating transcription factor 4 (ATF4) and negatively regulates the stress-dependent induction of the asparagine synthetase gene. J. Biol. Chem. 283: 35106—35117. PMID 18940792 DOI:10.1074/jbc.M806874200
  • Shoval Y., Berissi H., Kimchi A., Pietrokovski S. (2011). New modularity of DAP-kinases: alternative splicing of the DRP-1 gene produces a ZIPk-like isoform. PLoS ONE. 6: E17344—E17344. PMID 21408167 DOI:10.1371/journal.pone.0017344

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:786 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P18848 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 22
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші