FOXK2

FOXK2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1JXS, 2C6Y

Ідентифікатори
Символи FOXK2, ILF, ILF-1, ILF1, forkhead box K2, nGTBP
Зовнішні ІД OMIM: 147685 MGI: 1916087 HomoloGene: 18748 GeneCards: FOXK2
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
magnesium ion binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
цитоплазма

Біологічний процес

GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
protein deubiquitination
anatomical structure morphogenesis
диференціація клітин
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular glucose homeostasis
negative regulation of autophagy
regulation of glucose metabolic process
response to starvation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
canonical glycolysis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3607
68837
Ensembl
ENSG00000141568
ENSMUSG00000039275
UniProt
Q01167
Q3UCQ1
RefSeq (мРНК)
NM_004514
NM_181430
NM_181431
NM_001080932
NM_001363033
RefSeq (білок)
NP_004505
NP_001074401
NP_001349962
Локус (UCSC) Хр. 17: 82.52 – 82.64 Mb Хр. 11: 121.26 – 121.31 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXK2 (англ. Forkhead box K2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 69 062[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAAAAALSGAGTPPAGGGAGGGGAGGGGSPPGGWAVARLEGREFEYLMK
KRSVTIGRNSSQGSVDVSMGHSSFISRRHLEIFTPPGGGGHGGAAPELPP
AQPRPDAGGDFYLRCLGKNGVFVDGVFQRRGAPPLQLPRVCTFRFPSTNI
KITFTALSSEKREKQEASESPVKAVQPHISPLTINIPDTMAHLISPLPSP
TGTISAANSCPSSPRGAGSSGYKVGRVMPSDLNLMADNSQPENEKEASGG
DSPKDDSKPPYSYAQLIVQAITMAPDKQLTLNGIYTHITKNYPYYRTADK
GWQNSIRHNLSLNRYFIKVPRSQEEPGKGSFWRIDPASESKLIEQAFRKR
RPRGVPCFRTPLGPLSSRSAPASPNHAGVLSAHSSGAQTPESLSREGSPA
PLEPEPGAAQPKLAVIQEARFAQSAPGSPLSSQPVLITVQRQLPQAIKPV
TYTVATPVTTSTSQPPVVQTVHVVHQIPAVSVTSVAGLAPANTYTVSGQA
VVTPAAVLAPPKAEAQENGDHREVKVKVEPIPAIGHATLGTASRIIQTAQ
TTPVQTVTIVQQAPLGQHQLPIKTVTQNGTHVASVPTAVHGQVNNAAASP
LHMLATHASASASLPTKRHNGDQPEQPELKRIKTEDGEGIVIALSVDTPP
AAVREKGVQN

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

  • Li C., Lai C., Sigman D.S., Gaynor R.B. (1991). Cloning of a cellular factor, interleukin binding factor, that binds to NFAT-like motifs in the human immunodeficiency virus long terminal repeat. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7739—7743. PMID 1909027 DOI:10.1073/pnas.88.17.7739
  • Li C., Lusis A.J., Sparkes R., Nirula A., Gaynor R.B. (1992). Characterization and chromosomal mapping of the gene encoding the cellular DNA binding protein ILF. Genomics. 13: 665—671. PMID 1339390 DOI:10.1016/0888-7543(92)90139-J

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6036 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q01167 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші