NFATC4

NFATC4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2YRP

Ідентифікатори
Символи NFATC4, NF-AT3, NF-ATC4, NFAT3, nuclear factor of activated T-cells 4, nuclear factor of activated T cells 4
Зовнішні ІД OMIM: 602699 MGI: 1920431 HomoloGene: 3349 GeneCards: NFATC4
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001105 transcription coactivator activity
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
peroxisome proliferator activated receptor binding
chromatin binding

Клітинна компонента

transcription regulator complex
клітинне ядро
цитоплазма
гіалоплазма
nuclear speck

Біологічний процес

диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to lithium ion
negative regulation of chromatin binding
cellular response to UV
negative regulation of Wnt signaling pathway
calcineurin-NFAT signaling cascade
positive regulation of apoptotic signaling pathway
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
negative regulation of protein binding
smooth muscle cell differentiation
transcription, DNA-templated
regulation of synaptic plasticity
negative regulation of synapse maturation
heart development
negative regulation of dendrite morphogenesis
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
positive regulation of tumor necrosis factor production
branching involved in blood vessel morphogenesis
клітинне дихання
positive regulation of apoptotic process
inflammatory response
muscle cell development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
cellular response to ionomycin
GO:0032617 cytokine production
довготривала пам'ять
brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway
GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
довготривала потенціація
multicellular organism development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4776
73181
Ensembl
ENSG00000100968
ENSG00000285485
ENSMUSG00000023411
UniProt
Q14934
Q8K120
RefSeq (мРНК)
NM_001136022
NM_001198965
NM_001198966
NM_001198967
NM_001288802
NM_004554
NM_001320043
NM_001363681
NM_001363682
NM_001168346
NM_023699
RefSeq (білок)
NP_001129494
NP_001185894
NP_001185895
NP_001185896
NP_001275731
NP_001306972
NP_004545
NP_001350610
NP_001350611
NP_001161818
NP_076188
Локус (UCSC) Хр. 14: 24.37 – 24.38 Mb Хр. 14: 56.06 – 56.07 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NFATC4 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 902 амінокислот, а молекулярна маса — 95 449[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGAASCEDEELEFKLVFGEEKEAPPLGAGGLGEELDSEDAPPCCRLALGE
PPPYGAAPIGIPRPPPPRPGMHSPPPRPAPSPGTWESQPARSVRLGGPGG
GAGGAGGGRVLECPSIRITSISPTPEPPAALEDNPDAWGDGSPRDYPPPE
GFGGYREAGGQGGGAFFSPSPGSSSLSSWSFFSDASDEAALYAACDEVES
ELNEAASRFGLGSPLPSPRASPRPWTPEDPWSLYGPSPGGRGPEDSWLLL
SAPGPTPASPRPASPCGKRRYSSSGTPSSASPALSRRGSLGEEGSEPPPP
PPLPLARDPGSPGPFDYVGAPPAESIPQKTRRTSSEQAVALPRSEEPASC
NGKLPLGAEESVAPPGGSRKEVAGMDYLAVPSPLAWSKARIGGHSPIFRT
SALPPLDWPLPSQYEQLELRIEVQPRAHHRAHYETEGSRGAVKAAPGGHP
VVKLLGYSEKPLTLQMFIGTADERNLRPHAFYQVHRITGKMVATASYEAV
VSGTKVLEMTLLPENNMAANIDCAGILKLRNSDIELRKGETDIGRKNTRV
RLVFRVHVPQGGGKVVSVQAASVPIECSQRSAQELPQVEAYSPSACSVRG
GEELVLTGSNFLPDSKVVFIERGPDGKLQWEEEATVNRLQSNEVTLTLTV
PEYSNKRVSRPVQVYFYVSNGRRKRSPTQSFRFLPVICKEEPLPDSSLRG
FPSASATPFGTDMDFSPPRPPYPSYPHEDPACETPYLSEGFGYGMPPLYP
QTGPPPSYRPGLRMFPETRGTTGCAQPPAVSFLPRPFPSDPYGGRGSSFS
LGLPFSPPAPFRPPPLPASPPLEGPFPSQSDVHPLPAEGYNKVGPGYGPG
EGAPEQEKSRGGYSSGFRDSVPIQGITLEEVSEIIGRDLSGFPAPPGEEP
PA

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Hoey T., Sun Y.-L., Williamson K., Xu X. (1995). Isolation of two new members of the NF-AT gene family and functional characterization of the NF-AT proteins. Immunity. 2: 461—472. PMID 7749981 DOI:10.1016/1074-7613(95)90027-6
  • Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics. 92: 279—291. PMID 18675896 DOI:10.1016/j.ygeno.2008.06.011
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell. 96: 611—614. PMID 10089876 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80571-1
  • Yang T.T.C., Davis R.J., Chow C.-W. (2001). Requirement of two NFATc4 transactivation domains for CBP potentiation. J. Biol. Chem. 276: 39569—39576. PMID 11514544 DOI:10.1074/jbc.M102961200
  • Yang T.T.C., Xiong Q., Enslen H., Davis R.J., Chow C.-W. (2002). Phosphorylation of NFATc4 by p38 mitogen-activated protein kinases. Mol. Cell. Biol. 22: 3892—3904. PMID 11997522 DOI:10.1128/MCB.22.11.3892-3904.2002

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7778 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q14934 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші