ASCL1

ASCL1
Ідентифікатори
Символи ASCL1, ASH1, HASH1, MASH1, bHLHa46, achaete-scute family bHLH transcription factor 1
Зовнішні ІД OMIM: 100790 MGI: 96919 HomoloGene: 31234 GeneCards: ASCL1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
protein dimerization activity
protein homodimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
bHLH transcription factor binding
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
double-stranded DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
transcription factor binding

Клітинна компонента

neuronal cell body
клітинне ядро
RNA polymerase II transcription regulator complex

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain
sympathetic ganglion development
pattern specification process
noradrenergic neuron development
cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation
Нейрогенез
диференціація клітин
stomach neuroendocrine cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of neuron differentiation
response to retinoic acid
spinal cord association neuron differentiation
sympathetic nervous system development
neuroblast fate determination
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
spinal cord oligodendrocyte cell fate specification
musculoskeletal movement, spinal reflex action
negative regulation of apoptotic process
neuron migration
glial cell differentiation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cell maturation
cellular response to magnetism
oligodendrocyte differentiation
olfactory pit development
transcription, DNA-templated
lung neuroendocrine cell differentiation
нейробіологія розвитку
generation of neurons
response to lithium ion
multicellular organism development
positive regulation of neural precursor cell proliferation
adrenal chromaffin cell differentiation
positive regulation of neurogenesis
positive regulation of neuron apoptotic process
ventral spinal cord interneuron fate commitment
central nervous system neuron development
positive regulation of cell cycle
response to epidermal growth factor
regulation of cell population proliferation
vestibular nucleus development
positive regulation of neuron differentiation
regulation of mitotic cell cycle
forebrain neuron differentiation
cerebral cortex development
регуляція експресії генів
neuroblast proliferation
subpallium neuron fate commitment
regulation of timing of subpallium neuron differentiation
oligodendrocyte development
lung epithelial cell differentiation
carotid body glomus cell differentiation
response to folic acid
spinal cord oligodendrocyte cell differentiation
regulation of epithelial cell differentiation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
noradrenergic neuron fate commitment
regulation of Notch signaling pathway
regulation of neurogenesis
positive regulation of Notch signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
oligodendrocyte cell fate commitment
neuron differentiation
neuron fate commitment
neuron fate specification
neuron development
heart development
sensory organ development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
429
17172
Ensembl
ENSG00000139352
ENSMUSG00000020052
UniProt
P50553
Q02067
RefSeq (мРНК)
NM_004316
NM_008553
RefSeq (білок)
NP_004307
NP_032579
Локус (UCSC) Хр. 12: 102.96 – 102.96 Mb Хр. 10: 87.33 – 87.33 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ASCL1 (англ. Achaete-scute family bHLH transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 25 454[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MESSAKMESGGAGQQPQPQPQQPFLPPAACFFATAAAAAAAAAAAAAQSA
QQQQQQQQQQQQAPQLRPAADGQPSGGGHKSAPKQVKRQRSSSPELMRCK
RRLNFSGFGYSLPQQQPAAVARRNERERNRVKLVNLGFATLREHVPNGAA
NKKMSKVETLRSAVEYIRALQQLLDEHDAVSAAFQAGVLSPTISPNYSND
LNSMAGSPVSSYSSDEGSYDPLSPEEQELLDFTNWF

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Persson P., Joegi A., Grynfeld A., Paahlman S., Axelson H. (2000). HASH-1 and E2-2 are expressed in human neuroblastoma cells and form a functional complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 274: 22—31. PMID 10903890 DOI:10.1006/bbrc.2000.3090

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:738 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, P50553 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші