THRB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1BSX, 1N46, 1NAX, 1NQ0, 1NQ1, 1NQ2, 1NUO, 1Q4X, 1R6G, 1XZX, 1Y0X, 2J4A, 2NLL, 2PIN, 3D57, 3GWS, 3IMY, 3JZC, 4ZO1

Ідентифікатори

Символи

THRB, C-ERBA-2, C-ERBA-BETA, ERBA2, GRTH, NR1A2, PRTH, THR1, THRB1, THRB2, thyroid hormone receptor beta, TRbeta

Зовнішні ІД

OMIM: 190160 MGI: 98743 HomoloGene: 36025 GeneCards: THRB

Пов'язані генетичні захворювання

selective pituitary resistance to thyroid hormone, generalized resistance to thyroid hormone^[1]

Реагує на сполуку

DL-3,3',5'-triiodothyronine, tiratricol, трийодтиронін, левотироксин^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • chromatin DNA binding • thyroid hormone binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of heart contraction • female courtship behavior • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Q14865145 • type I pneumocyte differentiation • negative regulation of female receptivity • animal organ morphogenesis • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • steroid hormone mediated signaling pathway • intracellular receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • negative regulation of eye photoreceptor cell development • retinal cone cell development • retinal cone cell apoptotic process • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • thyroid gland development • response to lipid • thyroid hormone mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7068


21834

Ensembl


ENSG00000151090


ENSMUSG00000021779

UniProt


P10828


P37242

RefSeq (мРНК)

NM_000461 NM_001128176 NM_001128177 NM_001252634 NM_001354708
NM_001354709 NM_001354710 NM_001354711 NM_001354712 NM_001354713 NM_001354714 NM_001354715 NM_001374822 NM_001374823 NM_001374824 NM_001374825 NM_001374826 NM_001374827


NM_001113417 NM_009380

RefSeq (білок)

NP_000452 NP_001121648 NP_001121649 NP_001239563 NP_001341637
NP_001341638 NP_001341639 NP_001341640 NP_001341641 NP_001341642 NP_001341643 NP_001341644 NP_001361751 NP_001361752 NP_001361753 NP_001361754 NP_001361755 NP_001361756


NP_001106888 NP_033406

Локус (UCSC)

Хр. 3: 24.12 – 24.5 Mb

Хр. 14: 4.43 – 4.81 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

THRB (англ. Thyroid hormone receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 461 амінокислот, а молекулярна маса — 52 788^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPNSMTENG	LTAWDKPKHC	PDREHDWKLV	GMSEACLHRK	SHSERRSTLK
NEQSSPHLIQ	TTWTSSIFHL	DHDDVNDQSV	SSAQTFQTEE	KKCKGYIPSY
LDKDELCVVC	GDKATGYHYR	CITCEGCKGF	FRRTIQKNLH	PSYSCKYEGK
CVIDKVTRNQ	CQECRFKKCI	YVGMATDLVL	DDSKRLAKRK	LIEENREKRR
REELQKSIGH	KPEPTDEEWE	LIKTVTEAHV	ATNAQGSHWK	QKRKFLPEDI
GQAPIVNAPE	GGKVDLEAFS	HFTKIITPAI	TRVVDFAKKL	PMFCELPCED
QIILLKGCCM	EIMSLRAAVR	YDPESETLTL	NGEMAVTRGQ	LKNGGLGVVS
DAIFDLGMSL	SSFNLDDTEV	ALLQAVLLMS	SDRPGLACVE	RIEKYQDSFL
LAFEHYINYR	KHHVTHFWPK	LLMKVTDLRM	IGACHASRFL	HMKVECPTEL
FPPLFLEVFE	D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sakurai A., Nakai A., Degroot L.J. (1990). Structural analysis of human thyroid hormone receptor beta gene. Mol. Cell. Endocrinol. 71: 83—91. PMID 1973914 DOI:10.1016/0303-7207(90)90245-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Frankton S., Harvey C.B., Gleason L.M., Fadel A., Williams G.R. (2004). Multiple messenger ribonucleic acid variants regulate cell-specific expression of human thyroid hormone receptor beta1. Mol. Endocrinol. 18: 1631—1642. PMID 15105435 DOI:10.1210/me.2003-0346
Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002). ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator. Mol. Cell. Biol. 22: 3358—3372. PMID 11971969 DOI:10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002
Rastinejad F., Perlmann T., Evans R.M., Sigler P.B. (1995). Structural determinants of nuclear receptor assembly on DNA direct repeats. Nature. 375: 203—211. PMID 7746322 DOI:10.1038/375203a0
Parrilla R., Mixson A.J., McPherson J.A., McClaskey J.H., Weintraub B.D. (1991). Characterization of seven novel mutations of the c-erbA beta gene in unrelated kindreds with generalized thyroid hormone resistance. Evidence for two 'hot spot' regions of the ligand binding domain. J. Clin. Invest. 88: 2123—2130. PMID 1661299 DOI:10.1172/JCI115542

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з THRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Thyroid hormone receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11799 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, P10828 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма