HEY1

HEY1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2DB7

Ідентифікатори
Символи HEY1, BHLHb31, CHF2, HERP2, HESR1, HRT-1, OAF1, hHRT1, hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1, NERP2
Зовнішні ІД OMIM: 602953 MGI: 1341800 HomoloGene: 7756 GeneCards: HEY1
Онтологія гена
Молекулярна функція

microsatellite binding
DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001106 transcription corepressor activity
sequence-specific DNA binding
sequence-specific double-stranded DNA binding

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

dorsal aorta morphogenesis
pulmonary valve morphogenesis
negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in smooth muscle cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
heart trabecula formation
regulation of vasculogenesis
cardiac septum morphogenesis
ventricular septum morphogenesis
labyrinthine layer blood vessel development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
endocardial cushion morphogenesis
multicellular organism development
atrioventricular valve formation
arterial endothelial cell differentiation
cellular response to glucocorticoid stimulus
umbilical cord morphogenesis
negative regulation of transcription regulatory region DNA binding
Ангіогенез
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
cardiac ventricle morphogenesis
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of Notch signaling pathway
cardiac epithelial to mesenchymal transition
Notch signaling involved in heart development
Сигнальний шлях Notch
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
blood vessel development
heart development
диференціація клітин
regulation of neurogenesis
GO:1901313 positive regulation of gene expression
negative regulation of biomineral tissue development
anterior/posterior pattern specification
negative regulation of neuron differentiation
circulatory system development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23462
15213
Ensembl
ENSG00000164683
ENSMUSG00000040289
UniProt
Q9Y5J3
Q9WV93
Q9QUM5
RefSeq (мРНК)
NM_012258
NM_001040708
NM_001282851
NM_010423
RefSeq (білок)
NP_001035798
NP_001269780
NP_036390
NP_034553
Локус (UCSC) Хр. 8: 79.76 – 79.77 Mb Хр. 3: 8.73 – 8.73 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HEY1 (англ. Hes related family bHLH transcription factor with YRPW motif 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 304 амінокислот, а молекулярна маса — 32 613[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKRAHPEYSSSDSELDETIEVEKESADENGNLSSALGSMSPTTSSQILAR
KRRRGIIEKRRRDRINNSLSELRRLVPSAFEKQGSAKLEKAEILQMTVDH
LKMLHTAGGKGYFDAHALAMDYRSLGFRECLAEVARYLSIIEGLDASDPL
RVRLVSHLNNYASQREAASGAHAGLGHIPWGTVFGHHPHIAHPLLLPQNG
HGNAGTTASPTEPHHQGRLGSAHPEAPALRAPPSGSLGPVLPVVTSASKL
SPPLLSSVASLSAFPFSFGSFHLLSPNALSPSAPTQAANLGKPYRPWGTE
IGAF

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kokubo H., Lun Y., Johnson R.L. (1999). Identification and expression of a novel family of bHLH cDNAs related to Drosophila hairy and enhancer of split. Biochem. Biophys. Res. Commun. 260: 459—465. PMID 10403790 DOI:10.1006/bbrc.1999.0880
  • Leimeister C., Externbrinck A., Klamt B., Gessler M. (1999). Hey genes: a novel subfamily of hairy- and enhancer of split related genes specifically expressed during mouse embryogenesis. Mech. Dev. 85: 173—177. PMID 10415358 DOI:10.1016/S0925-4773(99)00080-5
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4880 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9Y5J3 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші