ETS2

ETS2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4BQA, 4MHV

Ідентифікатори
Символи ETS2, ETS2IT1, ETS proto-oncogene 2, transcription factor
Зовнішні ІД OMIM: 164740 MGI: 95456 HomoloGene: 3838 GeneCards: ETS2
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
glucocorticoid receptor binding
protein domain specific binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинна мембрана
нуклеоплазма
клітинне ядро
гіалоплазма

Біологічний процес

skeletal system development
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
ectodermal cell fate commitment
mesoderm development
primitive streak formation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2114
23872
Ensembl
ENSG00000157557
ENSMUSG00000022895
UniProt
P15036
P15037
RefSeq (мРНК)
NM_001256295
NM_005239
NM_011809
RefSeq (білок)
NP_001243224
NP_005230
NP_035939
Локус (UCSC) Хр. 21: 38.81 – 38.82 Mb Хр. 16: 95.5 – 95.52 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ETS2 (англ. ETS proto-oncogene 2, transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 53 001[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNDFGIKNMDQVAPVANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQ
EVPTGLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIP
KNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLEL
APDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPHWINSNTLGFGT
EQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRLSSVSVT
YCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQS
SLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIP
AAVLAGFTGSGPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVA
RRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLL
GFTPEELHAILGVQPDTED

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wasylyk C., Schlumberger S.E., Criqui-Filipe P., Wasylyk B. (2002). Sp100 interacts with ETS-1 and stimulates its transcriptional activity. Mol. Cell. Biol. 22: 2687—2702. PMID 11909962 DOI:10.1128/MCB.22.8.2687-2702.2002
  • Watson D.K., Mavrothalassitis G.J., Jorcyk C.L., Smyth F.E., Papas T.S. (1990). Molecular organization and differential polyadenylation sites of the human ETS2 gene. Oncogene. 5: 1521—1527. PMID 2250910

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3489 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P15036 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші