RFX6

RFX6
Ідентифікатори
Символи RFX6, MTCHRS, MTFS, RFXDC1, dJ955L16.1, regulatory factor X6
Зовнішні ІД OMIM: 612659 MGI: 2445208 HomoloGene: 18318 GeneCards: RFX6
Пов'язані генетичні захворювання
Mitchell-Riley syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity

Клітинна компонента

клітинне ядро
ядерце

Біологічний процес

диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
pancreatic epsilon cell differentiation
glucose homeostasis
regulation of insulin secretion
pancreatic A cell differentiation
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism development
positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus
type B pancreatic cell differentiation
pancreatic D cell differentiation
endocrine pancreas development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
222546
320995
Ensembl
ENSG00000185002
ENSMUSG00000019900
UniProt
Q8HWS3
Q8C7R7
RefSeq (мРНК)
NM_173560
NM_001159389
NM_177306
RefSeq (білок)
NP_775831
NP_001152861
NP_796280
Локус (UCSC) Хр. 6: 116.88 – 116.93 Mb Хр. 10: 51.55 – 51.61 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RFX6 (англ. Regulatory factor X6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 928 амінокислот, а молекулярна маса — 102 461[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKVPELEDTFLQAQPAPQLSPGIQEDCCVQLLGKGLLVYPEETVYLAAE
GQPGGEQGGGEKGEDPELPGAVKSEMHLNNGNFSSEEEDADNHDSKTKAA
DQYLSQKKTITQIVKDKKKQTQLTLQWLEENYIVCEGVCLPRCILYAHYL
DFCRKEKLEPACAATFGKTIRQKFPLLTTRRLGTRGHSKYHYYGIGIKES
SAYYHSVYSGKGLTRFSGSKLKNEGGFTRKYSLSSKTGTLLPEFPSAQHL
VYQGCISKDKVDTLIMMYKTHCQCILDNAINGNFEEIQHFLLHFWQGMPD
HLLPLLENPVIIDIFCVCDSILYKVLTDVLIPATMQEMPESLLADIRNFA
KNWEQWVVSSLENLPEALTDKKIPIVRRFVSSLKRQTSFLHLAQIARPAL
FDQHVVNSMVSDIERVDLNSIGSQALLTISGSTDTESGIYTEHDSITVFQ
ELKDLLKKNATVEAFIEWLDTVVEQRVIKTSKQNGRSLKKRAQDFLLKWS
FFGARVMHNLTLNNASSFGSFHLIRMLLDEYILLAMETQFNNDKEQELQN
LLDKYMKNSDASKAAFTASPSSCFLANRNKGSMVSSDAVKNESHVETTYL
PLPSSQPGGLGPALHQFPAGNTDNMPLTGQMELSQIAGHLMTPPISPAMA
SRGSVINQGPMAGRPPSVGPVLSAPSHCSTYPEPIYPTLPQANHDFYSTS
SNYQTVFRAQPHSTSGLYPHHTEHGRCMAWTEQQLSRDFFSGSCAGSPYN
SRPPSSYGPSLQAQDSHNMQFLNTGSFNFLSNTGAASCQGATLPPNSPNG
YYGSNINYPESHRLGSMVNQHVSVISSIRSLPPYSDIHDPLNILDDSGRK
QTSSFYTDTSSPVACRTPVLASSLQTPIPSSSSQCMYGTSNQYPAQETLD
SHGTSSREMVSSLPPINTVFMGTAAGGT

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Aftab S., Semenec L., Chu J.S.-C., Chen N. (2008). Identification and characterization of novel human tissue-specific RFX transcription factors. BMC Evol. Biol. 8: 226—226. PMID 18673564 DOI:10.1186/1471-2148-8-226

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з RFX6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21478 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
  5. UniProt, Q8HWS3 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші