FOXA1

FOXA1
Ідентифікатори
Символи FOXA1, HNF3A, TCF3A, forkhead box A1
Зовнішні ІД OMIM: 602294 MGI: 1347472 HomoloGene: 3307 GeneCards: FOXA1
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
protein domain specific binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

Мікроворсинки
клітинне ядро
fibrillar center
нуклеоплазма

Біологічний процес

Сигнальний шлях Notch
prostate gland stromal morphogenesis
dopaminergic neuron differentiation
positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway
response to estradiol
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
lung morphogenesis
glucose homeostasis
positive regulation of smoothened signaling pathway
lung development
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
neuron fate specification
anatomical structure formation involved in morphogenesis
positive regulation of mitotic cell cycle
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
tube morphogenesis
secretory columnal luminar epithelial cell differentiation involved in prostate glandular acinus development
transcription, DNA-templated
regulation of cell cycle
multicellular organism development
prostate gland epithelium morphogenesis
connective tissue development
positive regulation of neuron differentiation
epithelial cell maturation involved in prostate gland development
регуляція експресії генів
lung epithelial cell differentiation
dorsal/ventral neural tube patterning
epithelial-mesenchymal signaling involved in prostate gland development
epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
respiratory basal cell differentiation
hormone metabolic process
alveolar secondary septum development
negative regulation of epithelial to mesenchymal transition
positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
ремоделювання хроматину
anatomical structure morphogenesis
positive regulation of apoptotic process
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
диференціація клітин

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3169
15375
Ensembl
ENSG00000129514
ENSMUSG00000035451
UniProt
P55317
P35582
RefSeq (мРНК)
NM_004496
NM_008259
RefSeq (білок)
NP_004487
NP_032285
Локус (UCSC) Хр. 14: 37.59 – 37.6 Mb Хр. 12: 57.59 – 57.59 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXA1 (англ. Forkhead box A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот, а молекулярна маса — 49 148[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLGTVKMEGHETSDWNSYYADTQEAYSSVPVSNMNSGLGSMNSMNTYMTM
NTMTTSGNMTPASFNMSYANPGLGAGLSPGAVAGMPGGSAGAMNSMTAAG
VTAMGTALSPSGMGAMGAQQAASMNGLGPYAAAMNPCMSPMAYAPSNLGR
SRAGGGGDAKTFKRSYPHAKPPYSYISLITMAIQQAPSKMLTLSEIYQWI
MDLFPYYRQNQQRWQNSIRHSLSFNDCFVKVARSPDKPGKGSYWTLHPDS
GNMFENGCYLRRQKRFKCEKQPGAGGGGGSGSGGSGAKGGPESRKDPSGA
SNPSADSPLHRGVHGKTGQLEGAPAPGPAASPQTLDHSGATATGGASELK
TPASSTAPPISSGPGALASVPASHPAHGLAPHESQLHLKGDPHYSFNHPF
SINNLMSSSEQQHKLDFKAYEQALQYSPYGSTLPASLPLGSASVTTRSPI
EPSALEPAYYQGVYSRPVLNTS

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Bingle C.D., Gowan S. (1996). Molecular cloning of the forkhead transcription factor HNF-3 alpha from a human pulmonary adenocarcinoma cell line. Biochim. Biophys. Acta. 1307: 17—20. PMID 8652662 DOI:10.1016/0167-4781(96)00058-9
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5021 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, P55317 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.