HOXA5

HOXA5
Ідентифікатори
Символи HOXA5, HOX1, HOX1.3, HOX1C, homeobox A5
Зовнішні ІД OMIM: 142952 MGI: 96177 HomoloGene: 40726 GeneCards: HOXA5
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

embryonic skeletal system morphogenesis
pattern specification process
skeletal system development
respiratory system process
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism growth
lung development
trachea morphogenesis
bronchiole development
cell-cell signaling involved in mammary gland development
regulation of mammary gland epithelial cell proliferation
mammary gland alveolus development
lung goblet cell differentiation
transcription, DNA-templated
mammary gland epithelial cell differentiation
negative regulation of erythrocyte differentiation
respiratory gaseous exchange by respiratory system
trachea cartilage morphogenesis
embryonic skeletal system development
morphogenesis of an epithelium
multicellular organism development
thyroid gland development
lobar bronchus epithelium development
mesenchymal-epithelial cell signaling
positive regulation of apoptotic process
intestinal epithelial cell maturation
negative regulation of angiogenesis
cartilage morphogenesis
lung alveolus development
lung-associated mesenchyme development
epithelial tube branching involved in lung morphogenesis
cell migration
positive regulation of myeloid cell differentiation
anterior/posterior pattern specification
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3202
15402
Ensembl
ENSG00000106004
ENSMUSG00000038253
UniProt
P20719
P09021
RefSeq (мРНК)
NM_019102
NM_010453
RefSeq (білок)
NP_061975
NP_034583
Локус (UCSC) Хр. 7: 27.14 – 27.14 Mb Хр. 6: 52.18 – 52.18 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HOXA5 (англ. Homeobox A5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 29 345[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSYFVNSFCGRYPNGPDYQLHNYGDHSSVSEQFRDSASMHSGRYGYGYN
GMDLSVGRSGSGHFGSGERARSYAASASAAPAEPRYSQPATSTHSPQPDP
LPCSAVAPSPGSDSHHGGKNSLSNSSGASADAGSTHISSREGVGTASGAE
EDAPASSEQASAQSEPSPAPPAQPQIYPWMRKLHISHDNIGGPEGKRART
AYTRYQTLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIAHALCLSERQIKIWFQNRRMKW
KKDNKLKSMSMAAAGGAFRP

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Tournier-Lasserve E., Odenwald W.F., Garbern J., Trojanowski J., Lazzarini R.A. (1989). Remarkable intron and exon sequence conservation in human and mouse homeobox Hox 1.3 genes. Mol. Cell. Biol. 9: 2273—2278. PMID 2568583 DOI:10.1128/MCB.9.5.2273
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5106 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, P20719 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші