NKX3-1

NKX3-1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2L9R

Ідентифікатори
Символи NKX3-1, BAPX2, NKX3, NKX3.1, NKX3A, NK3 homeobox 1
Зовнішні ІД OMIM: 602041 MGI: 97352 HomoloGene: 4494 GeneCards: NKX3-1
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
histone deacetylase binding
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
estrogen receptor activity
protein kinase activator activity
protein self-association
MADS box domain binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
estrogen receptor binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity

Клітинна компонента

внутрішньоклітинний
клітинне ядро
site of DNA damage

Біологічний процес

somitogenesis
androgen receptor signaling pathway
cellular response to steroid hormone stimulus
dorsal aorta development
positive regulation of protein phosphorylation
male gonad development
positive regulation of cell death
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
protein kinase B signaling
response to testosterone
epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis
cellular response to tumor necrosis factor
positive regulation of androgen secretion
positive regulation of mitotic cell cycle
positive regulation of apoptotic signaling pathway
prostate gland development
negative regulation of gene expression
transcription, DNA-templated
multicellular organism development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
salivary gland development
heart development
positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of response to DNA damage stimulus
branching involved in prostate gland morphogenesis
negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development
positive regulation of cell population proliferation
cellular response to interleukin-1
negative regulation of epithelial cell proliferation
negative regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway
urogenital system development
positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
metanephros development
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
branching morphogenesis of an epithelial tube
positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
positive regulation of cell division
cellular response to hypoxia
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cell population proliferation
negative regulation of mitotic cell cycle
pharyngeal system development
activation of protein kinase activity
regulation of protein localization
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
диференціація клітин

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4824
18095
Ensembl
ENSG00000167034
ENSMUSG00000022061
UniProt
Q99801
P97436
RefSeq (мРНК)
NM_001256339
NM_006167
NM_010921
RefSeq (білок)
NP_001243268
NP_006158
NP_035051
Локус (UCSC) Хр. 8: 23.68 – 23.68 Mb Хр. 14: 69.43 – 69.43 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NKX3-1 (англ. NK3 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот, а молекулярна маса — 26 350[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLRVPEPRPGEAKAEGAAPPTPSKPLTSFLIQDILRDGAQRQGGRTSSQR
QRDPEPEPEPEPEGGRSRAGAQNDQLSTGPRAAPEEAETLAETEPERHLG
SYLLDSENTSGALPRLPQTPKQPQKRSRAAFSHTQVIELERKFSHQKYLS
APERAHLAKNLKLTETQVKIWFQNRRYKTKRKQLSSELGDLEKHSSLPAL
KEEAFSRASLVSVYNSYPYYPYLYCVGSWSPAFW

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Prescott J.L., Blok L., Tindall D.J. (1998). Isolation and androgen regulation of the human homeobox cDNA, NKX3.1. Prostate. 35: 71—80. PMID 9537602 DOI:10.1002/(SICI)1097-0045(19980401)35:1<71::AID-PROS10>3.0.CO;2-H
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chen H., Nandi A.K., Li X., Bieberich C.J. (2002). NKX-3.1 interacts with prostate-derived Ets factor and regulates the activity of the PSA promoter. Cancer Res. 62: 338—340. PMID 11809674

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7838 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, Q99801 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші