GABPA

GABPA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1AWC, 1SXD, 2JUO

Ідентифікатори
Символи GABPA, E4TF1-60, E4TF1A, NFT2, NRF2, NRF2A, RCH04A07, GA binding protein transcription factor alpha subunit, GA binding protein transcription factor subunit alpha
Зовнішні ІД OMIM: 600609 MGI: 95610 HomoloGene: 1543 GeneCards: GABPA
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001105 transcription coactivator activity
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
mitochondrion organization
in utero embryonic development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of megakaryocyte differentiation
transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
GO:1901313 positive regulation of gene expression
cellular response to dopamine
blastocyst formation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2551
14390
Ensembl
ENSG00000154727
ENSMUSG00000008976
UniProt
Q06546
Q8IYS3
Q00422
RefSeq (мРНК)
NM_001197297
NM_002040
NM_008065
RefSeq (білок)
NP_001184226
NP_002031
NP_002031.2
NP_032091
Локус (UCSC) Хр. 21: 25.73 – 25.77 Mb Хр. 16: 84.63 – 84.66 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GABPA (англ. GA binding protein transcription factor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 51 295[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTKREAEELIEIEIDGTEKAECTEESIVEQTYAPAECVSQAIDINEPIGN
LKKLLEPRLQCSLDAHEICLQDIQLDPERSLFDQGVKTDGTVQLSVQVIS
YQGIEPKLNILEIVKPADTVEVVIDPDAHHAESEAHLVEEAQVITLDGTK
HITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHWVVW
VMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPRGEILWSHLELLRKY
VLASQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQSATPTTIKVINSSAKAAKVQRAP
RISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKL
NQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFV
CDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQT
EKDN

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Gugneja S., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1995). Four structurally distinct, non-DNA-binding subunits of human nuclear respiratory factor 2 share a conserved transcriptional activation domain. Mol. Cell. Biol. 15: 102—111. PMID 7799916 DOI:10.1128/MCB.15.1.102

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4071 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q06546 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші