NR1H2

NR1H2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1P8D, 1PQ6, 1PQ9, 1PQC, 1UPV, 1UPW, 3KFC, 3L0E, 4DK7, 4DK8, 4RAK, 5HJP, 4NQA, 5I4V,%%s4NQA

Ідентифікатори
Символи NR1H2, LXR-b, LXRB, NER, NER-I, RIP15, UNR, Liver X receptor beta, nuclear receptor subfamily 1 group H member 2
Зовнішні ІД OMIM: 600380 MGI: 1352463 HomoloGene: 21397 GeneCards: NR1H2
Реагує на сполуку
(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
ATPase binding
zinc ion binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
зв'язування з іоном металу
retinoid X receptor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
steroid hormone receptor activity
apolipoprotein A-I receptor binding
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
transcription factor binding
nuclear receptor coactivator activity
signaling receptor activity

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
клітинне ядро
RNA polymerase II transcription regulator complex

Біологічний процес

positive regulation of high-density lipoprotein particle assembly
negative regulation of proteolysis
positive regulation of triglyceride biosynthetic process
GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process
negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway
positive regulation of cholesterol transport
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cellular lipid metabolic process
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of secretion of lysosomal enzymes
positive regulation of lipid storage
positive regulation of lipoprotein lipase activity
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of fatty acid biosynthetic process
negative regulation of gene expression
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of cholesterol storage
negative regulation of pinocytosis
GO:1901313 positive regulation of gene expression
retinoic acid receptor signaling pathway
positive regulation of cholesterol efflux
positive regulation of pancreatic juice secretion
lipid homeostasis
negative regulation of lipid transport
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
steroid hormone mediated signaling pathway
cholesterol homeostasis
lipid metabolism
multicellular organism development
диференціація клітин
cellular response to lipopolysaccharide
negative regulation of cold-induced thermogenesis
intracellular receptor signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7376
22260
Ensembl
ENSG00000131408
ENSMUSG00000060601
UniProt
P55055
Q60644
RefSeq (мРНК)
NM_007121
NM_001256647
NM_001285517
NM_001285518
NM_001285519
NM_009473
RefSeq (білок)
NP_001243576
NP_009052
NP_009052.3
NP_001272446
NP_001272447
NP_001272448
NP_033499
Локус (UCSC) Хр. 19: 50.33 – 50.38 Mb Хр. 7: 44.2 – 44.2 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NR1H2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 460 амінокислот, а молекулярна маса — 50 974[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSPTTSSLDTPLPGNGPPQPGAPSSSPTVKEEGPEPWPGGPDPDVPGTD
EASSACSTDWVIPDPEEEPERKRKKGPAPKMLGHELCRVCGDKASGFHYN
VLSCEGCKGFFRRSVVRGGARRYACRGGGTCQMDAFMRRKCQQCRLRKCK
EAGMREQCVLSEEQIRKKKIRKQQQESQSQSQSPVGPQGSSSSASGPGAS
PGGSEAGSQGSGEGEGVQLTAAQELMIQQLVAAQLQCNKRSFSDQPKVTP
WPLGADPQSRDARQQRFAHFTELAIISVQEIVDFAKQVPGFLQLGREDQI
ALLKASTIEIMLLETARRYNHETECITFLKDFTYSKDDFHRAGLQVEFIN
PIFEFSRAMRRLGLDDAEYALLIAINIFSADRPNVQEPGRVEALQQPYVE
ALLSYTRIKRPQDQLRFPRMLMKLVSLRTLSSVHSEQVFALRLQDKKLPP
LLSEIWDVHE

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Nuclear receptor subfamily 1 group H member 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7965 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, P55055 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші