FOXP1

FOXP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2KIU

Ідентифікатори
Символи FOXP1, 12CC4, HSPC215, MFH, QRF1, hFKH1B, forkhead box P1
Зовнішні ІД OMIM: 605515 MGI: 1914004 HomoloGene: 136512 GeneCards: FOXP1
Пов'язані генетичні захворювання
розлад дефіциту уваги та гіперактивності, intellectual disability-severe speech delay-mild dysmorphism syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

зв'язування з іоном металу
sequence-specific DNA binding
protein self-association
androgen receptor binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
transcription factor binding
protein homodimerization activity
protein heterodimerization activity

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
цитоплазма

Біологічний процес

regulation of monocyte differentiation
negative regulation of androgen receptor signaling pathway
negative regulation of B cell apoptotic process
positive regulation of endothelial cell migration
transcription, DNA-templated
response to lipopolysaccharide
regulation of defense response to bacterium
endothelial cell activation
regulation of endothelial tube morphogenesis
macrophage activation
osteoclast development
positive regulation of smooth muscle cell proliferation
T follicular helper cell differentiation
regulation of macrophage colony-stimulating factor production
regulation of tumor necrosis factor production
regulation of inflammatory response
osteoclast differentiation
monocyte activation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
somatic stem cell population maintenance
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
in utero embryonic development
positive regulation of mesenchymal cell proliferation
pre-B cell differentiation
positive regulation of immunoglobulin production
heart development
skeletal muscle tissue development
motor neuron axon guidance
ventral spinal cord development
striatum development
lung development
forebrain development
immunoglobulin V(D)J recombination
response to testosterone
sarcomere organization
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
smooth muscle tissue development
positive regulation of epithelial cell proliferation
cardiac muscle cell differentiation
regulation of cardiac muscle cell proliferation
negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development
lung secretory cell differentiation
cellular response to tumor necrosis factor
innate vocalization behavior
regulation of action potential
regulation of lung goblet cell differentiation
negative regulation of lung goblet cell differentiation
cellular response to ionomycin
positive regulation of hydrogen peroxide-induced cell death
positive regulation of cardiac muscle cell differentiation
cellular response to DNA damage stimulus
negative regulation of gene expression
positive regulation of B cell receptor signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
27086
108655
Ensembl
ENSG00000114861
ENSMUSG00000030067
UniProt
Q9H334
P58462
RefSeq (мРНК)
NM_001012505
NM_001244808
NM_001244810
NM_001244812
NM_001244813
NM_001244814
NM_001244815
NM_001244816
NM_032682
NM_001349338
NM_001349340
NM_001349341
NM_001349342
NM_001349343
NM_001349344
NM_001349337
NM_001370548
NM_001197321
NM_001197322
NM_053202
NM_001347345
RefSeq (білок)
NP_001012523
NP_001231737
NP_001231739
NP_001231741
NP_001231742
NP_001231743
NP_001231744
NP_001231745
NP_116071
NP_001336267
NP_001336269
NP_001336270
NP_001336271
NP_001336272
NP_001336273
NP_001336266
NP_001184250
NP_001184251
NP_001334274
NP_444432
Локус (UCSC) Хр. 3: 70.95 – 71.58 Mb Хр. 6: 98.93 – 99.52 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FOXP1 (англ. Forkhead box P1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 75 317[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMQESGTETKSNGSAIQNGSGGSNHLLECGGLREGRSNGETPAVDIGAAD
LAHAQQQQQQALQVARQLLLQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVA
MMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQ
QEQLQLQLLQQQHAGKQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQ
RQGLLTIQPGQPALPLQPLAQGMIPTELQQLWKEVTSAHTAEETTGNNHS
SLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMNPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEEHPHSH
PLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQ
LELQLAKDKERLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLSKSASEASP
QSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVITTTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSA
DIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNEIYNWFTRMFA
YFRRNAATWKNAVRHNLSLHKCFVRVENVKGAVWTVDEVEFQKRRPQKIS
GNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLAS
AIREELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHVKEEPLDPEEAEGPLS
LVTTANHSPDFDHDRDYEDEPVNEDME

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Jepsen K., Gleiberman A.S., Shi C., Simon D.I., Rosenfeld M.G. (2008). Cooperative regulation in development by SMRT and FOXP1. Genes Dev. 22: 740—745. PMID 18347093 DOI:10.1101/gad.1637108
  • Sin C., Li H., Crawford D.A. (2015). Transcriptional Regulation by FOXP1, FOXP2, and FOXP4 Dimerization. J. Mol. Neurosci. 55: 437—448. PMID 25027557 DOI:10.1007/s12031-014-0359-7
  • Vernes S.C., MacDermot K.D., Monaco A.P., Fisher S.E. (2009). Assessing the impact of FOXP1 mutations on developmental verbal dyspraxia. Eur. J. Hum. Genet. 17: 1354—1358. PMID 19352412 DOI:10.1038/ejhg.2009.43

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з FOXP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3823 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, Q9H334 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші