KLF5

KLF5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2EBT

Ідентифікатори
Символи KLF5, BTEB2, CKLF, IKLF, Kruppel-like factor 5 (intestinal), Kruppel like factor 5
Зовнішні ІД OMIM: 602903 MGI: 1338056 HomoloGene: 37520 GeneCards: KLF5
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
зв'язування з іоном металу
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleic acid binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
MRF binding

Клітинна компонента

комплекс Ґольджі
внутрішньоклітинна мембранна органела
нуклеоплазма
клітинне ядро
transcription regulator complex

Біологічний процес

regulation of microvillus assembly
microvillus assembly
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
intestinal epithelial cell development
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
Ангіогенез
skeletal muscle cell differentiation
positive regulation of fat cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
positive regulation of cell population proliferation
cellular response to peptide
cellular response to leukemia inhibitory factor
cell-cell signaling via exosome
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
регуляція експресії генів
skeletal muscle satellite cell differentiation
satellite cell activation involved in skeletal muscle regeneration
myotube differentiation involved in skeletal muscle regeneration
skeletal muscle tissue regeneration
positive regulation of transcription by transcription factor localization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
688
12224
Ensembl
ENSG00000102554
ENSMUSG00000005148
UniProt
Q13887
Q9Z0Z7
RefSeq (мРНК)
NM_001730
NM_001286818
NM_009769
RefSeq (білок)
NP_001273747
NP_001721
NP_033899
Локус (UCSC) Хр. 13: 73.05 – 73.08 Mb Хр. 14: 99.54 – 99.55 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KLF5 (англ. Kruppel like factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 457 амінокислот, а молекулярна маса — 50 792[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATRVLSMSARLGPVPQPPAPQDEPVFAQLKPVLGAANPARDAALFPGEE
LKHAHHRPQAQPAPAQAPQPAQPPATGPRLPPEDLVQTRCEMEKYLTPQL
PPVPIIPEHKKYRRDSASVVDQFFTDTEGLPYSINMNVFLPDITHLRTGL
YKSQRPCVTHIKTEPVAIFSHQSETTAPPPAPTQALPEFTSIFSSHQTAA
PEVNNIFIKQELPTPDLHLSVPTQQGHLYQLLNTPDLDMPSSTNQTAAMD
TLNVSMSAAMAGLNTHTSAVPQTAVKQFQGMPPCTYTMPSQFLPQQATYF
PPSPPSSEPGSPDRQAEMLQNLTPPPSYAATIASKLAIHNPNLPTTLPVN
SQNIQPVRYNRRSNPDLEKRRIHYCDYPGCTKVYTKSSHLKAHLRTHTGE
KPYKCTWEGCDWRFARSDELTRHYRKHTGAKPFQCGVCNRSFSRSDHLAL
HMKRHQN

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Shi H., Zhang Z., Wang X., Liu S., Teng C.T. (1999). Isolation and characterization of a gene encoding human Kruppel-like factor 5 (IKLF): binding to the CAAT/GT box of the mouse lactoferrin gene promoter. Nucleic Acids Res. 27: 4807—4815. PMID 10572182 DOI:10.1093/nar/27.24.4807
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6349 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q13887 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 13
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші