KLF4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2WBS, 2WBU, 4M9E

Ідентифікатори

Символи

KLF4, EZF, GKLF, Kruppel-like factor 4 (gut), Kruppel like factor 4

Зовнішні ІД

OMIM: 602253 MGI: 1342287 HomoloGene: 3123 GeneCards: KLF4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • phosphatidylinositol 3-kinase regulator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase II sequence-specific DNA-binding transcription factor recruiting activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • double-stranded DNA binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription coregulator binding • histone deacetylase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • Хроматин • клітинне ядро
Біологічний процес	• negative regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production • epidermal cell differentiation • cellular response to retinoic acid • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of muscle hyperplasia • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of axon regeneration • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process • response to retinoic acid • somatic stem cell population maintenance • cellular response to laminar fluid shear stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • epidermis morphogenesis • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • cellular response to growth factor stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • post-embryonic hemopoiesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • response to organic substance • negative regulation of gene expression • negative regulation of response to cytokine stimulus • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • stem cell population maintenance • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of cell migration • regulation of cell population proliferation • post-embryonic camera-type eye development • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of telomerase activity • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • регуляція диференціювання клітин • mesodermal cell fate determination • negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to cycloheximide • negative regulation of inflammatory response • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • negative regulation of leukocyte adhesion to arterial endothelial cell • positive regulation of core promoter binding • cellular response to leukemia inhibitory factor • negative regulation of angiogenesis • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of sprouting angiogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9314


16600

Ensembl


ENSG00000136826


ENSMUSG00000003032

UniProt


O43474


Q60793

RefSeq (мРНК)


NM_001314052 NM_004235


NM_010637

RefSeq (білок)


NP_001300981 NP_004226


NP_034767

Локус (UCSC)

Хр. 9: 107.48 – 107.49 Mb

Хр. 4: 55.53 – 55.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KLF4 (англ. Kruppel like factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 54 671^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRQPPGESDM	AVSDALLPSF	STFASGPAGR	EKTLRQAGAP	NNRWREELSH
MKRLPPVLPG	RPYDLAAATV	ATDLESGGAG	AACGGSNLAP	LPRRETEEFN
DLLDLDFILS	NSLTHPPESV	AATVSSSASA	SSSSSPSSSG	PASAPSTCSF
TYPIRAGNDP	GVAPGGTGGG	LLYGRESAPP	PTAPFNLADI	NDVSPSGGFV
AELLRPELDP	VYIPPQQPQP	PGGGLMGKFV	LKASLSAPGS	EYGSPSVISV
SKGSPDGSHP	VVVAPYNGGP	PRTCPKIKQE	AVSSCTHLGA	GPPLSNGHRP
AAHDFPLGRQ	LPSRTTPTLG	LEEVLSSRDC	HPALPLPPGF	HPHPGPNYPS
FLPDQMQPQV	PPLHYQGQSR	GFVARAGEPC	VCWPHFGTHG	MMLTPPSSPL
ELMPPGSCMP	EEPKPKRGRR	SWPRKRTATH	TCDYAGCGKT	YTKSSHLKAH
LRTHTGEKPY	HCDWDGCGWK	FARSDELTRH	YRKHTGHRPF	QCQKCDRAFS
RSDHLALHMK	RHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wei X., Xu H., Kufe D. (2007). Human mucin 1 oncoprotein represses transcription of the p53 tumor suppressor gene. Cancer Res. 67: 1853—1858. PMID 17308127 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-3063
Zhang P., Andrianakos R., Yang Y., Liu C., Lu W. (2010). Kruppel-like factor 4 (Klf4) prevents embryonic stem (ES) cell differentiation by regulating Nanog gene expression. J. Biol. Chem. 285: 9180—9189. PMID 20071344 DOI:10.1074/jbc.M109.077958
Bjerke G.A., Hyman-Walsh C., Wotton D. (2011). Cooperative transcriptional activation by Klf4, Meis2, and Pbx1. Mol. Cell. Biol. 31: 3723—3733. PMID 21746878 DOI:10.1128/MCB.01456-10

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6348 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O43474 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма