LEF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2LEF, 3OUW, 3OUX

Ідентифікатори

Символи

LEF1, LEF-1, TCF10, TCF1ALPHA, TCF7L3, lymphoid enhancer binding factor 1

Зовнішні ІД

MGI: 96770 HomoloGene: 7813 GeneCards: LEF1

Пов'язані генетичні захворювання

хронічний лімфолейкоз, системний червоний вовчак^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • armadillo repeat domain binding • estrogen receptor binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • estrogen receptor activity • gamma-catenin binding • GO:0031493 histone binding • C2H2 zinc finger domain binding • chromatin binding • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding, bending • DNA binding • sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • beta-catenin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex • beta-catenin-TCF complex • нуклеоплазма • protein-DNA complex
Біологічний процес	• somitogenesis • tongue development • paraxial mesoderm formation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA binding • T cell receptor V(D)J recombination • transcription by RNA polymerase II • cellular response to cytokine stimulus • mammary gland development • negative regulation of interleukin-13 production • odontogenesis of dentin-containing tooth • apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis • cell chemotaxis • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • face morphogenesis • neutrophil differentiation • negative regulation of interleukin-5 production • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dentate gyrus development • apoptotic process involved in morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell growth • regulation of Wnt signaling pathway • embryonic limb morphogenesis • hypothalamus development • branching involved in blood vessel morphogenesis • trachea gland development • regulation of striated muscle tissue development • positive regulation of cell-cell adhesion • forebrain neuroblast division • eye pigmentation • negative regulation of apoptotic process • sprouting angiogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • BMP signaling pathway • positive regulation of cell cycle process • osteoblast differentiation • histone H3 acetylation • formation of radial glial scaffolds • positive regulation of granulocyte differentiation • alpha-beta T cell differentiation • canonical Wnt signaling pathway • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • sensory perception of taste • cellular response to interleukin-4 • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • розвиток клітин • negative regulation of cell-cell adhesion • negative regulation of interleukin-4 production • negative regulation of striated muscle tissue development • positive regulation of cell migration • Wnt signaling pathway • T-helper 1 cell differentiation • positive regulation of cell proliferation in bone marrow • anatomical structure regression • chorio-allantoic fusion • negative regulation of apoptotic process in bone marrow cell • B cell proliferation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • vasculature development • forebrain radial glial cell differentiation • neural crest cell migration • positive regulation of cell population proliferation • forebrain neuron differentiation • histone H4 acetylation • hippocampus development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway • steroid hormone mediated signaling pathway • odontoblast differentiation • beta-catenin-TCF complex assembly • Епітеліально-мезенхімальний перехід • regulation of cell-cell adhesion • secondary palate development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51176


16842

Ensembl


ENSG00000138795


ENSMUSG00000027985

UniProt


Q9UJU2 Q659G9


P27782

RefSeq (мРНК)


NM_001130713 NM_001130714 NM_001166119 NM_016269

NM_001276402 NM_001276403 NM_010703 NM_001379059 NM_001379060
NM_001379061 NM_001379062

RefSeq (білок)


NP_001124185 NP_001124186 NP_001159591 NP_057353 NP_057353.1

NP_001263331 NP_001263332 NP_034833 NP_001365988 NP_001365989
NP_001365990 NP_001365991

Локус (UCSC)

Хр. 4: 108.05 – 108.17 Mb

Хр. 3: 130.9 – 131.02 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LEF1 (англ. Lymphoid enhancer binding factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 201^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPQLSGGGGG	GGGDPELCAT	DEMIPFKDEG	DPQKEKIFAE	ISHPEEEGDL
ADIKSSLVNE	SEIIPASNGH	EVARQAQTSQ	EPYHDKAREH	PDDGKHPDGG
LYNKGPSYSS	YSGYIMMPNM	NNDPYMSNGS	LSPPIPRTSN	KVPVVQPSHA
VHPLTPLITY	SDEHFSPGSH	PSHIPSDVNS	KQGMSRHPPA	PDIPTFYPLS
PGGVGQITPP	LGWQGQPVYP	ITGGFRQPYP	SSLSVDTSMS	RFSHHMIPGP
PGPHTTGIPH	PAIVTPQVKQ	EHPHTDSDLM	HVKPQHEQRK	EQEPKRPHIK
KPLNAFMLYM	KEMRANVVAE	CTLKESAAIN	QILGRRWHAL	SREEQAKYYE
LARKERQLHM	QLYPGWSARD	NYGKKKKRKR	EKLQESASGT	GPRMTAAYI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Waterman M.L., Fischer W.H., Jones K.A. (1991). A thymus-specific member of the HMG protein family regulates the human T cell receptor C alpha enhancer. Genes Dev. 5: 656—669. PMID 2010090 DOI:10.1101/gad.5.4.656
Hovanes K., Li T.W., Waterman M.L. (2000). The human LEF-1 gene contains a promoter preferentially active in lymphocytes and encodes multiple isoforms derived from alternative splicing. Nucleic Acids Res. 28: 1994—2003. PMID 10756202 DOI:10.1093/nar/28.9.1994
Jesse S., Koenig A., Ellenrieder V., Menke A. (2010). Lef-1 isoforms regulate different target genes and reduce cellular adhesion. Int. J. Cancer. 126: 1109—1120. PMID 19653274 DOI:10.1002/ijc.24802
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bruhn L., Munnerlyn A., Grosschedl R. (1997). ALY, a context-dependent coactivator of LEF-1 and AML-1, is required for TCRalpha enhancer function. Genes Dev. 11: 640—653. PMID 9119228 DOI:10.1101/gad.11.5.640
Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors. Nucleic Acids Res. 29: 1410—1419. PMID 11266540 DOI:10.1093/nar/29.7.1410

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LEF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6551 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UJU2 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма