KLF10

KLF10
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2EPA

Ідентифікатори
Символи KLF10, EGR-alpha, EGRA, TIEG, TIEG1, Kruppel-like factor 10, Kruppel like factor 10
Зовнішні ІД OMIM: 601878 MGI: 1101353 HomoloGene: 4135 GeneCards: KLF10
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleic acid binding
core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

skeletal system development
bone mineralization
cellular response to peptide
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
somatic stem cell population maintenance
ритмічний процес
cell-cell signaling
positive regulation of osteoclast differentiation
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription, DNA-templated
циркадний ритм
проліферація
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
negative regulation of cell population proliferation
cellular response to starvation
regulation of circadian rhythm
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7071
21847
Ensembl
ENSG00000155090
ENSMUSG00000037465
UniProt
Q13118
O89091
RefSeq (мРНК)
NM_001032282
NM_005655
NM_001289471
NM_013692
NM_001357677
RefSeq (білок)
NP_001027453
NP_005646
NP_001276400
NP_038720
NP_001344606
Локус (UCSC) Хр. 8: 102.65 – 102.66 Mb Хр. 15: 38.29 – 38.3 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KLF10 (англ. Kruppel like factor 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 52 555[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLNFGASLQQTAEERMEMISERPKESMYSWNKTAEKSDFEAVEALMSMSC
SWKSDFKKYVENRPVTPVSDLSEEENLLPGTPDFHTIPAFCLTPPYSPSD
FEPSQVSNLMAPAPSTVHFKSLSDTAKPHIAAPFKEEEKSPVSAPKLPKA
QATSVIRHTADAQLCNHQTCPMKAASILNYQNNSFRRRTHLNVEAARKNI
PCAAVSPNRSKCERNTVADVDEKASAALYDFSVPSSETVICRSQPAPVSP
QQKSVLVSPPAVSAGGVPPMPVICQMVPLPANNPVVTTVVPSTPPSQPPA
VCPPVVFMGTQVPKGAVMFVVPQPVVQSSKPPVVSPNGTRLSPIAPAPGF
SPSAAKVTPQIDSSRIRSHICSHPGCGKTYFKSSHLKAHTRTHTGEKPFS
CSWKGCERRFARSDELSRHRRTHTGEKKFACPMCDRRFMRSDHLTKHARR
HLSAKKLPNWQMEVSKLNDIALPPTPAPTQ

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Blok L.J., Grossmann M.E., Perry J.E., Tindall D.J. (1995). Characterization of an early growth response gene, which encodes a zinc finger transcription factor, potentially involved in cell cycle regulation. Mol. Endocrinol. 9: 1610—1620. PMID 8584037 DOI:10.1210/mend.9.11.8584037
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Johnsen S.A., Subramaniam M., Monroe D.G., Janknecht R., Spelsberg T.C. (2002). Modulation of transforming growth factor beta (TGFbeta)/Smad transcriptional responses through targeted degradation of TGFbeta-inducible early gene-1 by human seven in absentia homologue. J. Biol. Chem. 277: 30754—30759. PMID 12072443 DOI:10.1074/jbc.M204812200
  • Chrisman H.R., Tindall D.J. (2003). Identification and characterization of a consensus DNA binding element for the zinc finger transcription factor TIEG/EGRalpha. DNA Cell Biol. 22: 187—199. PMID 12804117 DOI:10.1089/104454903321655819

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11810 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, Q13118 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші