NR4A2

NR4A2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1OVL

Ідентифікатори
Символи NR4A2, HZF-3, NOT, NURR1, RNR1, TINUR, nuclear receptor subfamily 4 group A member 2
Зовнішні ІД OMIM: 601828 MGI: 1352456 HomoloGene: 4509 GeneCards: NR4A2
Онтологія гена
Молекулярна функція

retinoid X receptor binding
protein homodimerization activity
sequence-specific DNA binding
beta-catenin binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
steroid hormone receptor activity
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
glucocorticoid receptor binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
zinc ion binding
зв'язування з іоном металу
DNA binding
protein heterodimerization activity
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
нуклеоплазма
nuclear speck
transcription regulator complex

Біологічний процес

dopaminergic neuron differentiation
cellular response to oxidative stress
response to hypoxia
response to amphetamine
нейробіологія розвитку
neuron maturation
steroid hormone mediated signaling pathway
central nervous system projection neuron axonogenesis
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
central nervous system neuron differentiation
negative regulation of apoptotic signaling pathway
cellular response to corticotropin-releasing hormone stimulus
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of respiratory gaseous exchange
regulation of dopamine metabolic process
adult locomotory behavior
регуляція експресії генів
habenula development
GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
fat cell differentiation
post-embryonic development
dopamine biosynthetic process
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
canonical Wnt signaling pathway
general adaptation syndrome
neuron differentiation
GO:0072468 сигнальна трансдукція
dopamine metabolic process
transcription, DNA-templated
intracellular receptor signaling pathway
neuron migration
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to extracellular stimulus
midbrain dopaminergic neuron differentiation
експресія генів
transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4929
18227
Ensembl
ENSG00000153234
ENSMUSG00000026826
UniProt
P43354
Q06219
RefSeq (мРНК)
NM_006186
NM_173171
NM_173172
NM_173173
NM_001139509
NM_013613
RefSeq (білок)
NP_006177
NP_775265
NP_006177.1
NP_001132981
NP_038641
Локус (UCSC) Хр. 2: 156.32 – 156.34 Mb Хр. 2: 57 – 57.01 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NR4A2 (англ. Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 598 амінокислот, а молекулярна маса — 66 591[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPCVQAQYGSSPQGASPASQSYSYHSSGEYSSDFLTPEFVKFSMDLTNTE
ITATTSLPSFSTFMDNYSTGYDVKPPCLYQMPLSGQQSSIKVEDIQMHNY
QQHSHLPPQSEEMMPHSGSVYYKPSSPPTPTTPGFQVQHSPMWDDPGSLH
NFHQNYVATTHMIEQRKTPVSRLSLFSFKQSPPGTPVSSCQMRFDGPLHV
PMNPEPAGSHHVVDGQTFAVPNPIRKPASMGFPGLQIGHASQLLDTQVPS
PPSRGSPSNEGLCAVCGDNAACQHYGVRTCEGCKGFFKRTVQKNAKYVCL
ANKNCPVDKRRRNRCQYCRFQKCLAVGMVKEVVRTDSLKGRRGRLPSKPK
SPQEPSPPSPPVSLISALVRAHVDSNPAMTSLDYSRFQANPDYQMSGDDT
QHIQQFYDLLTGSMEIIRGWAEKIPGFADLPKADQDLLFESAFLELFVLR
LAYRSNPVEGKLIFCNGVVLHRLQCVRGFGEWIDSIVEFSSNLQNMNIDI
SAFSCIAALAMVTERHGLKEPKRVEELQNKIVNCLKDHVTFNNGGLNRPN
YLSKLLGKLPELRTLCTQGLQRIFYLKLEDLVPPPAIIDKLFLDTLPF

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Mages H.W., Rilke O., Bravo R., Senger G., Kroczek R.A. (1994). NOT, a human immediate-early response gene closely related to the steroid/thyroid hormone receptor NAK1/TR3. Mol. Endocrinol. 8: 1583—1591. PMID 7877627 DOI:10.1210/mend.8.11.7877627
  • Torii T., Kawarai T., Nakamura S., Kawakami H. (1999). Organization of the human orphan nuclear receptor Nurr1 gene. Gene. 230: 225—232. PMID 10216261 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00064-5
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Messmer K., Remington M.P., Skidmore F., Fishman P.S. (2007). Induction of tyrosine hydroxylase expression by the transcription factor Pitx3. Int. J. Dev. Neurosci. 25: 29—37. PMID 17184956 DOI:10.1016/j.ijdevneu.2006.11.003
  • Garcia-Yague A.J., Rada P., Rojo A.I., Lastres-Becker I., Cuadrado A. (2013). Nuclear import and export signals control the subcellular localization of Nurr1 protein in response to oxidative stress. J. Biol. Chem. 288: 5506—5517. PMID 23283970 DOI:10.1074/jbc.M112.439190

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7981 (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, P43354 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші